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2022年7月13日
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分子力?
根据
量子力?
的
波恩-?本海默近似
,一?分子的能量可以近似看作?成分子的各?原子的空?坐?的函?,??地?就是分子的能量?分子?型的?化而?化,而描述??分子能量和分子??之??系的就是分子力?函?。分子力?函???自???果的??公式,可以??分子能量的模?比?粗?,但是相比于精?的
量子力?
???算
方法,分子力?方法的?算量要小?十倍,而且在适?的范??,分子力?方法的?算精度?量子化??算相差无?,因此?大分子???系而言,分子力?方法是一套行之有效的方法。以分子力??基?的
分子力?
?算方法在
分子?力?
、
蒙特??方法
、
分子?接
等分子模?方法中有着?泛的?用。
?成
[
??
]
一般而言,分子力?函?由以下??部分?成:
- ?伸?能:?成分子的各?化??在??方向上的伸???所引起的能量?化
- ?角?曲能:?角?化引起的分子能量?化
- 二面角?曲能:??旋?引起分子骨架?曲所?生的能量?化
- 非?相互作用:包括
范德?力
、??相互作用等?能量有?的非?相互作用
- 交叉能量?:上述作用之??合引起的能量?化
?成一套力?函??系需要有一套?系分子能量和?型的函?,?需要?出各?不同原子在不同成
?
??下的物理??,比如正常的??、?角、二面角等,?些力???多?自??或者量子化??算。
常用力?函?和分?
[
??
]
不同的分子力???取不同的函?形式?描述上述能量??系?型之?的?系。到目前,不同的科?????了?多适用于不同?系的力?函?,根据他???的函?和力???,可以分?以下??
- ??力?
- AMBER力?
:由Kollman?????的力?,是目前使用比??泛的一?力?,适合?理生物大分子。
- CHARMM力?
:由Karplus?????,?小分子?系到溶?化的大分子?系都有?好的?合。
- CVFF力?
:CVFF力?是一?可以用于无机?系?算的力?
- MMX力?
:MMX力?包括MM2和MM3,是目前?用最??泛的一?力?,主要??有机小分子
- 第二代力?
- 第二代的?能函?形式比??力?要更加??,涉及的力???更多,?算量也更大,?然也相?地更加准?。
- 通用力?
- 通用力?也叫基于??的力?,?所?用的力???是基于原子性??算所得,用?可以通?自主?定一系列分子作???集?生成合用的力???
- 反?力?
- 是一?基于??的分子力?,常用于分子?力?模?
- ??力?因不能?足?裂和形成?的要求而不能模?化?反?,因而ReaxFF避?了?式的??基于??,?而允???的?的形成或?裂
??
[
??
]