En la temporada 1965/1966, Vicente Calderon presidia el At.Madrid y Domingo Balmanya ejercia como entrenador. La entidad incorporo a Victor (Indauchu) y a Isidro II (Racing); y recupero a Rodri cedido al Pontevedra. En cuanto a las bajas, Ramiro se retiro; Zamanillo firmo por el Racing y Eulogio Martinez por el Europa; y Yanko Daucik, Pinol, Trallero, Rives, Mario Vega y Olalde abandonaron el club.
Madinabeytia se erigio en el arquero titular, Rodri jugo varios partidos y San Roman fue el tercer portero. En la zaga, Griffa se convirtio en el eje indiscutible mientras que Colo suplio la baja por lesion de Calleja en bastantes encuentros y Rivilla siguio como lateral zurdo titular; ademas, Martinez Jayo actuo de comodin y el canterano Garcia cumplio. En el mediocampo, Glaria fue titular indiscutible acompanado unas veces por Ruiz Sosa, otras por Rivilla o Jayo, y en menor medida por Luis Aragones o Adelardo; Victor y Polo apenas jugaron. En la delantera, Ufarte, Luis Aragones, Mendoza, Adelardo y Collar fue el quinteto titular; y Cardona, Jones, Fretes e Isidro II quedaron como recambios.
El R.Madrid, que habia conquistado las ultimas cinco Ligas, partia como el maximo favorito. El 5 de septiembre de 1965, en la 1ª jornada, el At.Madrid empato a dos goles contra el Zaragoza en La Romareda y a la siguiente semana se impuso por 3-0 al Elche en el Metropolitano.
Luego, los colchoneros vencieron al At.Bilbao en San Mames, empataron frente al R. Madrid en el Metropolitano y batieron al Barcelona en el Nou Camp. El Atletico siguio ganando con lo que despues de diez fechas ocupaba el liderato. Mas tarde, el Atletico perdio su primer partido ante el Pontevedra en Pasaron. Al final de la primera vuelta, el At.Madrid sumaba tres puntos mas que Pontevedra, Madrid y Valencia.
En el inicio de la segunda vuelta, el once madrileno sufrio un bache durante enero y febrero que estuvo a punto de costarle el titulo. Tras caer por 3-1 contra el R. Madrid, los rojiblancos cedieron el liderato que ostentaban desde la 4ª jornada. El R. Madrid se coloco primero con 31+9 seguido del At.Madrid con 29+9 y el Barcelona con 27+5. Encima, el Barcelona se impuso por 1-0 al At.Madrid en el Metropolitano. Tanto los jugadores como el entrenador mostraron su escasa moral para conquistar la Liga. Una semana despues, el Atletico empato frente al Mallorca en el Lluis Sitjar. A falta de siete choques, el R. Madrid sumaba 34+10, el Barcelona 31+7 y el At.Madrid 30+8.
Entonces, el At.Madrid reacciono al vencer al Sabadell, Betis, Pontevedra, Valencia y Cordoba. A falta de dos partidos, el R.Madrid comandaba la tabla con 41+13 puntos perseguido por el At.Madrid con 40+12 y el Barcelona con 36+8. En la penultima fecha, el At.Madrid gano por 2-0 a Las Palmas en el Metropolitano y el Barcelona supero por 2-1 al Madrid en el Nou Camp. El Atletico se coloco lider con un punto de ventaja sobre el Madrid.
En la ultima jornada, la Liga se decidiria en el Espanol-At.Madrid y el R.Madrid-Mallorca. Los equipos madrilenos se jugaban el titulo mientras que sus rivales luchaban por evitar el descenso. El Atletico se proclamaba campeon con la victoria; si empataba debia aguardar una igualada o derrota merengue; y si perdia debia esperar la derrota blanca. El 3 de abril de 1966, el At.Madrid salto a Sarria con este once: Madinabeytia, Colo, Griffa, Rivilla; Luis Aragones, Glaria; Ufarte, Jones, Mendoza, Adelardo y Collar. En el minuto 43, Ufarte consiguio el 1-0 y al filo del descanso Griffa amplio la ventaja. En la segunda parte, el cuadro de Balmanya conservo el resultado gracias al orden y seriedad de su linea defensiva. El R. Madrid goleo por 5-1 al Mallorca. El At.Madrid se adjudico la quinta Liga de su historia (1ª de Vicente Calderon). Los colchoneros rompian 15 anos de sequia en la Liga. La clave radico en el final liguero del Atletico al lograr siete victorias en los ultimos siete partidos. La hinchada colchonera celebro por todo lo alto el titulo en Sarria; y al dia siguiente, unos 4.000 aficionados recibieron al equipo en Atocha al grito de “¡Aliron, aliron, aliron, el Atleti es campeon!”.
Por ultimo, la inmobiliaria Vista Hermosa permitio terminar la temporada al Atletico en el Metropolitano mientras se concluian las obras en el Estadio del Manzanares donde jugaria en la campana venidera. Y el At.Madrid cayo en los ¼ de final de la Recopa ante el Borussia Dortmund (R.F.A.) y en la misma ronda de la Copa del Generalisimo frente al At.Bilbao.