Orthocoronavirinae

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Orthocoronavirinae
Taxonomia
Dominio : Riboviria
Reino : Orthornavirae
Filo : Pisuviricota
Clase : Pisoniviricetes
Orden : Nidovirales
Suborden: Cornidovirineae
Familia : Coronaviridae
Subfamilia: Orthocoronavirinae
Clasificacion de Baltimore
Grupo: IV ( Virus ARN monocatenario positivo )
Generos [ 1 ] ​
[ editar datos en Wikidata ]

Orthocoronavirinae , comunmente conocidos como coronavirus , es una subfamilia de virus ARN monocatenario positivos perteneciente a la familia Coronaviridae . Se subdivide en los generos Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Gammacoronavirus y Deltacoronavirus . [ 2 ] ​ [ 3 ] ​ Estos incluyen genogrupos filogeneticamente similares de virus con una nucleocapside de simetria helicoidal con envoltura cuyos viriones pueden medir entre aproximadamente 50 y 200  nm de diametro. Su material genetico es el de mayor tamano dentro de los virus de ARN , con genomas que van desde los 26 a 32 kilonucleotidos . [ 4 ] ​ [ 5 ] ​ Se les llama coronavirus por la corona de puntas que se ve alrededor de la superficie del virus. Fue descrito por primera vez en 1965. [ 6 ] ​

Los coronavirus pueden infectar aves y mamiferos produciendo una serie de enfermedades respiratorias y digestivas, muchas de ellas letales trayendo como consecuencia serios perjuicios en la avicultura y la ganaderia ; tambien pueden infectar al ser humano causando enfermedades que van desde el resfriado comun hasta enfermedades mas graves, como bronquitis , bronquiolitis , neumonia , el sindrome respiratorio de Oriente Medio (MERS), el sindrome respiratorio agudo grave (SARS) y el COVID-19 , entre otras. La mayoria de las personas se infectan con estos virus en algun momento de su vida. [ 2 ] ​ [ 7 ] ​ [ 3 ] ​ [ 8 ] ​

Hasta la fecha se han registrado cuarenta y cinco especies de coronavirus. [ 1 ] ​ Varias especies son de reciente investigacion [ 8 ] ​ debido a que varias cepas particulares no habian sido identificadas previamente en humanos. [ 9 ] ​ Existe poca informacion sobre la transmision, gravedad e impacto clinico [ 9 ] ​ y no existen tratamientos aprobados hasta la fecha, [ 8 ] ​ sin embargo se pueden tratar varios de los sintomas, las opciones terapeuticas dependen del estado clinico de cada paciente. [ 8 ] ​

El genero Alphacoronavirus ?anteriormente conocido como Coronavirus grupo 1 (CoV-1)? incluye los subgrupos 1a y 1b, cuyos integrantes mas representativos son el coronavirus humano 229E (HCoV-229E) y HCoV-NL63, asi como la nueva especie alfacoronavirus 1 ?incluyendo virus de la gastroenteritis transmisible porcina (TGEV)?, respectivamente. El genero Betacoronavirus ?anteriormente Betacoronavirus grupo 2 (Cov-2)? incluye varios subgrupos. Los mas prominentes (subgrupos 2a y 2b) tienen como especies tipo las especies de coronavirus murino ?incluido el virus de la hepatitis de raton (MHV)? y el SARS-CoV , respectivamente. Los generos Alphacoronavirus y Betacoronavirus provienen del pool genetico que tiene a murcielagos como huesped. El genero Gammacoronavirus incluye todos los coronavirus aviares identificados hasta 2009. [ 10 ] ​ [ 11 ] ​

Historia natural [ editar ]

El ancestro comun mas reciente del coronavirus se ha encontrado en el siglo IX a. C. Estudios realizados durante 1990 lograron datar los ancestros comunes mas recientes de los generos: [ cita requerida ]

  • Betacoronavirus: 3300 a. C.
  • Deltacoronavirus: 3000 a. C.
  • Gammacoronavirus: 2800 a. C.
  • Alphacoronavirus: 2400 a. C.

De acuerdo a estos estudios, en ese entonces el factor principal de la fuente del coronavirus era la sangre caliente, particularmente de los murcielagos y pajaros. El coronavirus bovino se separo de la especie equina coronavirus al final del siglo  XVIII . El coronavirus bovino y el coronavirus humano OC43 se separaron en 1899. Otra estimacion sugiere que el coronavirus humano OC43 divergio del coronavirus bovino en 1890. El coronavirus bovino y el canino respiratorio con el coronavirus divergieron de un ancestro comun en 1951. El ancestro comun mas reciente del coronavirus humano OC43 ha sido fechado en la decada de 1950. El sindrome respiratorio coronavirus de Oriente Medio, aunque relacionado con varias especies de murcielagos, parece haber divergido de estos hace varios siglos. El coronavirus de murcielago esta mas estrechamente relacionado con el coronavirus del SARS, del que se separo en 1986. [ 12 ] ​ [ 13 ] ​ [ 14 ] ​ [ 15 ] ​ [ 16 ] ​ [ 17 ] ​ [ 18 ] ​ [ 19 ] ​ [ 20 ] ​ [ 21 ] ​ [ 22 ] ​

Estructura [ editar ]

Animacion de un virion representativo de Orthocoronavirinae, la seccion transversal indica los componentes y proteinas que pueden ser parte de su estructura

Las partes que conforman la estructura general de los coronavirus son, como en todos los virus animales, la envoltura y la nucleocapside . En el caso de los coronavirus, en la envoltura se encuentra una glucoproteina de membrana (M) de 20 a 35 kDa, que forma una matriz en contacto con la nucleocapside. Ademas se encuentra en la envoltura la glucoproteina S, de 180 a 220 kDa, [ 23 ] ​ que forma las espiculas, espigas o peplomeros responsables de la adhesion a la celula huesped. En el caso especifico del coronavirus SARS , en sus espiculas un dominio de union para receptores definidos dirigen la adherencia del virus a su receptor celular , la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE-2). [ 24 ] ​ Algunos coronavirus (especificamente los miembros de Betacoronavirus subgrupo A, tambien llamado subgenero Embecovirus [ 25 ] ​) tienen tambien en la superficie una proteina adicional mas corta llamada esterasa - hemaglutinina . [ 26 ] ​

Replicacion [ editar ]

La replicacion de los coronavirus comienza con la entrada en la celula , momento en que pierde su envoltura, y el genoma de ARN se libera en el citoplasma . El genoma del coronavirus tiene un caperuza metilada en el extremo 5' (extremo cap'), y una cola poliadenilada (poly A) en el extremo 3', dandole un gran parecido al ARN mensajero eucariota . Esto permite que al ARN se le adhieran los ribosomas citoplasmaticos para su traduccion . Los coronavirus tienen tambien una proteina replicasa codificada en su codigo genetico, que le permite generar nuevas copias de su ARN sin necesidad de transcribirse a ADN, usando los recursos de la celula huesped. Esta replicasa es la primera proteina que se sintetiza ya que una vez que el gen que codifica la replicasa es traducido (sintesis proteica), el proceso se detiene por un codon de parada. [ 27 ] ​ Esto se conoce como una transcripcion anidada. Cuando el transcrito de ARNm solo codifica un gen, se conoce como monocistronico. El genoma de ARN se replica a cadena negativa y de esta se forman copias positivas de la que se traduce una larga poliproteina, que debera ser escindida en las distintas proteinas funcionales del virus. Los coronavirus tienen para ello una proteasa denominada Mpro o 3CLpro [ 28 ] ​ que corta la poliproteina para dar lugar a las proteinas viricas (maduracion de la poliproteina). Esta es una estrategia virica para la economia genetica, ya que le permite codificar un buen numero de proteinas con un numero pequeno de transcritos a la vez que mejora la tasa de fallos durante la ejecucion de la ARN polimerasa. [ 29 ] ​ [ 27 ] ​ Dicha proteasa es un objetivo de farmacos para impedir la replicacion del virus. [ 30 ] ​

Humanos [ editar ]

Los coronavirus humanos fueron descritos por primera vez en la decada de 1960 en cavidades nasales de pacientes con un resfriado comun. Estos virus fueron nombrados posteriormente coronavirus humano 229E y OC43. Otros dos miembros de esta familia han sido identificados, el HCoV-NL63 en 2004 y HKU1 en 2005. Los cuales circulan globalmente en la poblacion humana y causan aproximadamente un tercio de los casos de resfriado comun . Al igual que otros tipos de virus pueden causar enfermedades mas graves del sistema respiratorio como bronquitis o neumonia especialmente en personas con factores de riesgo , ancianos, ninos y pacientes inmunodeprimidos. Ademas de afecciones respiratorias tambien pueden causar enfermedades intestinales y neurologicas. [ 31 ] ​

Existen registros de siete cepas de coronavirus relacionados con enfermedades respiratorias en humanos (HCoV):

  1. Coronavirus humano 229E
  2. Coronavirus humano OC43
  3. SARS-CoV
  4. Coronavirus humano NL63
  5. Coronavirus humano HKU1
  6. Coronavirus del sindrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV).
  7. SARS-CoV-2 ( COVID-19 ). [ 32 ] ​ [ 33 ] ​

Despues de la publicacion del perfil de los brotes de SARS en 2003, resucito entre los virologos un interes por los coronavirus. Durante muchos anos, los cientificos sabian de solo dos coronavirus humanos (HCoV-229E y OC43-HCoV). El descubrimiento de SARS-CoV anadio un tercer coronavirus humano. A finales de 2004, tres laboratorios de investigacion independientes informaron del descubrimiento de un cuarto coronavirus humano, nombrado NL63, NL, y coronavirus de New Haven simultaneamente por varios grupos de investigacion. Los tres laboratorios siguen discutiendo sobre cual de ellos descubrio el virus en primer lugar y por tanto tiene derecho a nombrarlo. A principios de 2005, un equipo de investigacion de la Universidad de Hong Kong informo del hallazgo de un quinto coronavirus humano en dos pacientes con neumonia. Lo llamaron coronavirus humano HKU1. El brote de neumonia 2019-20 en Wuhan, China, llevo al hallazgo de un coronavirus nuevo, catalogado como 2019-nCoV por la OMS. [ 34 ] ​ [ 35 ] ​ [ 32 ] ​ [ 33 ] ​

Sindrome respiratorio agudo grave [ editar ]

Articulo principal: Sindrome respiratorio agudo grave

En 2003, tras el brote del SARS (sindrome respiratorio agudo grave), que habia comenzado en el ano 2002 en Asia, y luego en otras partes del mundo, la Organizacion Mundial de la Salud (OMS) emitio un comunicado de prensa indicando que un coronavirus de nueva identificacion por parte una serie de laboratorios era el agente causante del SARS. El virus fue nombrado oficialmente como coronavirus del SARS (SARS-CoV). Mas de 8000 personas resultaron infectadas, alrededor del 10% de los cuales murieron. [ 26 ] ​

Sindrome respiratorio de Medio Oriente [ editar ]

Articulo principal: Coronavirus del sindrome respiratorio de Oriente Medio

En septiembre de 2012, se identifico un nuevo tipo de coronavirus, llamado inicialmente coronavirus nuevo 2012, y ahora con el nombre oficial coronavirus del sindrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV). La Organizacion Mundial de la Salud emitio una alerta mundial poco despues. La actualizacion de la OMS el 28 de septiembre de 2012 declaro que no parecia que el virus se transmitiese facilmente de persona a persona. Sin embargo, el 12 de mayo de 2013, un caso de transmision de humano a humano en Francia fue confirmado por el Ministerio de Asuntos Sociales y de Salud de Francia. Ademas, los casos de transmision de humano a humano han sido reportados por el Ministerio de Salud de Tunez. Dos casos confirmados parecen haber contraido la enfermedad de su difunto padre, quienes se enfermaron despues de una visita a Catar y Arabia Saudita. A pesar de esto, parece que el virus tiene problemas para la difusion de humano a humano, ya que la mayoria de las personas que estan infectadas no transmiten el virus. [ 36 ] ​ [ 37 ] ​ [ 38 ] ​ [ 39 ] ​ [ 40 ] ​ [ 41 ] ​

Para el 30 de octubre de 2013, habia en Arabia Saudita 124 casos y 52 muertes. Despues de que el Centro Medico Erasmus neerlandes secuencio el virus, le dio un nombre nuevo, coronavirus humano-Centro Medico Erasmus (HCoV-CEM). El nombre final para el virus es coronavirus del sindrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV). En mayo de 2014 se registraron los dos unicos casos de infeccion con MERS-CoV en los Estados Unidos, ocurrieron en trabajadores de la salud que trabajaron en Arabia Saudita y luego se desplazaron a Estados Unidos. Ambos individuos fueron hospitalizados temporalmente y luego dados de alta. En mayo de 2015, un brote de MERS-CoV se produjo en Corea del Sur, cuando un hombre que habia viajado a Oriente Medio, visito 4 hospitales diferentes en el area de Seul para tratar su enfermedad. Esto provoco uno de los mayores brotes de MERS-CoV fuera del Medio Oriente. En diciembre de 2019, 2.468 casos de infeccion MERS-CoV habian sido confirmados por medio de pruebas de laboratorio, casos de los cuales 851 fueron mortales, una tasa de mortalidad de aproximadamente el 34,5%. [ 42 ] ​ [ 43 ] ​ [ 44 ] ​ [ 45 ] ​

SARS-CoV-2 [ editar ]

Esta seccion es un extracto de SARS-CoV-2 . [ editar ]
Micrografia electronica de transmision de viriones de SARS-CoV-2 , aislados desde un paciente. Imagen coloreada, para resaltar los virus.

El coronavirus de tipo 2 causante del sindrome respiratorio agudo severo, [ 46 ] ​ abreviado SARS-CoV-2 (del ingles severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 ) [ 47 ] ​ o SRAS-CoV-2, [ 46 ] ​ es un tipo de coronavirus causante de la enfermedad por coronavirus de 2019 , [ 48 ] ​ [ 49 ] ​ [ 50 ] ​ cuya expansion mundial provoco la pandemia de COVID-19 . Inicialmente fue llamado 2019-nCoV (en ingles : 2019-novel coronavirus , ‘nuevo coronavirus de 2019’) y tambien, ocasionalmente, HCoV-19 (en ingles : human coronavirus 2019 ). [ 51 ] ​ [ 52 ] ​ Se descubrio y se aislo por primera vez en Wuhan , China . Tiene un origen zoonotico , es decir, que se transmitio de un huesped animal a uno humano. [ 53 ] ​

Es un clado dentro de la familia de los Coronaviridae , genero Betacoronavirus , subgenero Sarbecovirus , especie virus SARS [ 54 ] ​ (virus relacionado con el sindrome respiratorio agudo severo o grave). [ 55 ] ​

El genoma del virus esta formado por una sola cadena de ARN , y se clasifica como un virus ARN monocatenario positivo . Su secuencia genetica se ha aislado a partir de una muestra obtenida de un paciente afectado por neumonia en la ciudad china de Wuhan, aunque la falta de experimento de control doble ciego en la tecnica de secuenciacion publicada puede poner en cuestionamiento la validez cientifica de la tecnica. [ 56 ] ​ [ 57 ] ​ [ 58 ] ​ [ 59 ] ​ [ 60 ] ​ [ 61 ] ​ Se detecto por primera vez el 12 de noviembre de 2019. Puede producir el contagio de una persona a otra mediante las gotas de saliva expulsadas a traves de la tos y el estornudo o al espirar (vease gotitas de Flugge ). [ 62 ] ​ [ 63 ] ​ Puede provocar enfermedad respiratoria aguda y neumonia grave en los seres humanos. [ 64 ] ​

Aunque previamente no habia ningun tratamiento especifico aprobado oficialmente, ya se habian desarrollado algunos antivirales existentes, asi como el tratamiento con plasma convaleciente y la dexametasona , que parecen tener una mayor eficacia en el manejo de los sintomas o que parecen acortar el periodo de recuperacion en poblaciones especiales. [ 65 ] ​ [ 66 ] ​ En diciembre de 2020 comenzo una campana de vacunacion con las primeras vacunas experimentales autorizadas en emergencia, que se prolongo y mantuvo durante 2021 y 2022. [ cita requerida ] Fue Pfizer - BioNTech , con la vacuna Comirnaty , los laboratorios pioneros en patentar una vacuna [ 67 ] ​ y posteriormente, los laboratorios Moderna y AstraZeneca se unieron a esta carrera por la vacuna . [ 68 ] ​

Veterinaria [ editar ]

Los coronavirus han sido reconocidos como causantes de condiciones patologicas en veterinaria desde principios de 1970. A excepcion de la bronquitis infecciosa aviar , las principales enfermedades relacionadas tienen principalmente una ubicacion intestinal .

Los coronavirus infectan principalmente el tracto respiratorio y gastrointestinal superior de mamiferos y aves. Actualmente se conocen siete cepas del coronavirus que infectan a los humanos. Se cree que los coronavirus causan un porcentaje significativo de todos los resfriados comunes en personas adultas y ninos. Los coronavirus causan resfriados con sintomas importantes; por ejemplo, fiebre, inflamacion de las adenoides de la garganta, en los seres humanos principalmente en las temporadas de invierno y primavera temprana. Los coronavirus puede causar neumonia, ya sea neumonia viral directa o una neumonia bacteriana secundaria, y la bronquitis, ya sea bronquitis viral directa o una bronquitis bacteriana secundaria. El coronavirus humano mas conocido fue descubierto en 2003, SARS-CoV que causa el sindrome respiratorio agudo grave (SARS), tiene una patogenesis unica porque causa que infecciones de las vias respiratorias tanto superior como inferior. La importancia economica y el impacto de los coronavirus como agentes causantes del resfriado comun son dificiles de evaluar debido a que, a diferencia de los rinovirus (otro virus del resfriado comun), los coronavirus humanos son dificiles de cultivar en el laboratorio. [ 69 ] ​ [ 70 ] ​

Los coronavirus tambien causan una serie de enfermedades en los animales de granja y mascotas domesticadas, algunos de los cuales pueden ser graves y son una amenaza para la industria agricola. En los pollos, el virus de la bronquitis infecciosa (IBV), es un coronavirus que afecta no solo las vias respiratorias, sino tambien el tracto urogenital. El virus puede propagarse a los diferentes organos del cuerpo de la gallina. Los que tienen consecuencias economicamente significativas en los animales de granja incluyen el coronavirus porcino (coronavirus de la gastroenteritis transmisible, TGE) y el coronavirus bovino, el cual causa diarrea en los animales jovenes. Coronavirus felino: existen dos formas, el coronavirus enterico felino es un patogeno de importancia clinica menor, pero la mutacion espontanea de este virus puede provocar una peritonitis infecciosa felina (FIP), una enfermedad asociada con una alta mortalidad. Del mismo modo, hay dos tipos de coronavirus que infectan a los hurones: el coronavirus enterico de huron causa un sindrome gastrointestinal conocido como epizootica catarral enteritis (ECE), y una version sistemica mas letal del virus (como FIP en los gatos), conocido en hurones como coronavirus sistemico de huron (FSC). Hay dos tipos de coronavirus canino (CoVC), uno que causa la enfermedad gastrointestinal leve y uno que causa enfermedad respiratoria. El virus de la hepatitis del raton (MHV) es un coronavirus que causa una enfermedad epidemica murina con una mortalidad alta, especialmente entre las colonias de ratones de laboratorio. [ 71 ] ​ [ 72 ] ​ [ 73 ] ​ El virus de la sialodacrioadenitis (sialo saliva, dacrio lagrima) es un coronavirus altamente infeccioso de ratas de laboratorio, que puede transmitirse entre individuos por contacto directo o indirectamente por las secreciones en aerosol. Las infecciones agudas tienen una alta morbilidad y tropismo para las glandulas salivales , lacrimales y harderiana . [ 74 ] ​

Uno relacionado con el coronavirus murcielago Rinolophus HKU2 llamado coronavirus del sindrome de diarrea aguda porcina (SADS-CoV) (del ingles swine acute diarrhea syndrome) causa diarrea en cerdos. [ 75 ] ​

Antes del descubrimiento de SARS-CoV, MHV habia sido estudiado tanto in vivo como in vitro , asi como a nivel molecular. Algunas cepas de MHV causaron una encefalitis desmielinizante progresiva en ratones a los que se ha utilizado como modelo murino para la esclerosis multiple. Importantes esfuerzos de investigacion se han centrado en dilucidar la patogenesis viral de estos coronavirus de animales, especialmente por los virologos interesados en las enfermedades zoonoticas y veterinarios. [ 76 ] ​

Ciclo de infeccion de los coronavirus [ 77 ] ​

Listado de los coronavirus de animales domesticos [ editar ]

Otra enfermedad veterinaria nueva, virus de la diarrea epidemica porcina (PED o PEDV), ha surgido en todo el mundo. Su importancia economica es aun poco clara, pero muestra una alta mortalidad en los lechones. [ 78 ] ​ [ 79 ] ​ [ 80 ] ​

Taxonomia [ editar ]

Escultura coronavirus ubicada en el Instituto de Investigaciones Biomedicas de la UNAM , Mexico

Los generos , subgeneros y especies incluidas en Orthocoronavirinae son: [ 81 ] ​

Vease tambien [ editar ]

Bibliografia [ editar ]

Referencias [ editar ]

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