達爾文雀 ? 加拉?戈斯群島 ?同島進化出?同形狀? 啄 ，適應?同島?環境。

?同物種? 蟹 ? ? gong 6 形狀都?同，而?種差異源於??需要適應??同環境?度生存。

進化 （ ?? ： zeon 3 faa 3 ； 英文 ： evolution ）， ?語 口語 又可以叫 演化 jin 2 faa 3 ，? 生物學 上係指一個 族群 ? 生物 ? 可遺傳 特徵一代一代?演變?過程，而進化? 操作 定義 （實際科?用?定義）係「一個族群內部各 基因 ?出現頻率隨住 時間 而改變?過程」 ^{[1] [2]} 。

進化論 基於 遺傳學 ：所有 物種 （包括 人 ）都有 DNA ，?? DNA 係由 基因 組成，而多數物種都或多或少有個體差異－就算係同種?生物，隻隻身上帶?基因都同同類個體身上?有??同，而?點引致每個個體? 特徵 上都有??同；根據 物競天擇 ，因?個體差異，一個族群?個體當中可能有?比較擅長生存同 繁殖 ，生存同繁殖能力勁?個體會更加大 機會 能?將自己?基因傳?下一代 ^{[註 1]} ，所以一個族群?基因代代都會有些少?同?樣；除??，繁殖? 細胞分裂 等?過程之中仲會有 突變 等?現象。因???緣故，經過幾百萬年?時間，一個族群變變?就會變到同之前完全?同?樣，而?群新?生物? DNA 帶?基因同之前?好?同，差異可能大到算係一個新?物種 ^{[3] [4]} 。

進化同 生物多樣性 好有拏?， 新物種出現 主要係?進化引起?：例如有個族群，??因? 氣候變化 等?原因?到??原本住?地方?再???住，於是??就遷徙去第?地方，可能?過程入面分開?做兩組，一組遷徙去地方 A，?一組遷徙去地方 B，而?兩個地方?環境好?同，一個凍?一個熱?，但兩個都??種生物住；長遠?講，?凍地區住?組會進化出有利?寒冷環境生存?特徵（例如係 皮下脂肪 變厚），而?熱地區住?組會進化出有利?炎熱環境生存?特徵（例如係皮下脂肪變薄）。十萬年後，兩組變到好?同 ^{[註 2]} －變?做兩個?同?物種，不過??仲有個 共同祖先 ^{[5] [6]} 。 地球 上面次次有親?族群內部分開搬去?同環境?度住?陣，個族群?各組就會慢慢?適應各自?新環境而變樣－令地球有?富?生物多樣性 ^[7] 。

對進化??究好有用：?實際應用方面， 科學 上對進化?了解經已?人應用? 農業 同 醫學 等?領域?度，例如了解 細菌 ?進化對於醫藥?究者整 抗生素 ?講好緊要 ^[8] ；而且進化?相關?念仲? AI 上有用，例如 進化演算法 就運用?物競天擇?原理做 機械學習 ，用「一代一代淘汰表現差?模型」?方法得出表現優良?模型 ^{[9] [10]} 。

詞源

英文 入面? evolution 一詞係?自 拉丁文 ? evolvere ，後者?意思本?係「將一?卷埋???打開」，而家? 生物學 上用?隻詞係指「? 地球 歷史上，?同類? 生物 點樣由早期?形式發展出?」?一種自然現象。?個詞??一世紀初?英文入面亦有 ?義 ?問題：?日常英文用語裏面， evolution ?隻字有時?人用?指 發展 或者 進步 等?意思，又或者係? 某?大?媒體 ?度指一?「有?似生物學上?進化，但又?係生物學上?進化??」。因??，家陣?生物學家?做親??有關進化?學術討論?陣，好多時都會?楚?講到明??傾緊?係

生物進化 （ biological evolution ）

－指一個族群?生物隨住世代而出現遺傳上?改變?一種自然現象 ^[11] 。

對進化論?發展貢獻重大? 達爾文 都有用 evolve ?隻字：達爾文??本名著《 物種起源 》 ^{[e 1]} ? 1859 年第一版係用 evolved ?隻字結尾?；而雖然達爾文打後又有用

• 經過改變?繼承 ^{[e 2]} 、
• 改變過程 ^{[e 3]} 同埋
• 物種改變?原理 ^{[e 4]}

等?字眼?形容生物進化??念，不過到?《物種起源》最後? 1876 年第六版，達爾文用? evolution ?隻字好多次，仲直接??套理論做 進化論 ^{[e 5]} ，奠定? evolution ?隻字?使用 ^{[12] [13]} 。

?語 會用? 進化 一詞，被指係由 日本 ? 和製漢字 ?度 借過? ?：《物種起源》第一本 中文 版由 馬君武 ?譯，同早期少少? 日文 版一樣用而家用緊? 進化 一詞；而??一世紀初， 臺灣 以外?大中華地區普遍都係用緊 進化 ?兩隻 漢字 表示 evolution ?意思－??語入邊，?兩隻字係讀做 zeon 3 faa 3 ? ^[14] 。

順帶一提，?世紀 漢語 又有用 天演 （ ?? ： tin 1 jin 2 ）?隻字詞指 evolution ，?隻少人用?字詞係由 嚴復 譯?本《 天演論 》?度走出?? ^[15] 。

基本?念

遺傳

?一世紀進化論最基本??念係 遺傳 ^{[e 6]} ，?係 父母 將自己?特徵傳? 仔女 ?過程。由日常生活? 觀察 可以得知以下?事實 ^{[16] [17]} ：

• 人與人之間?各種特徵－包括 頭髮 同 眼珠 ? 色水 以至 身高 同 體能 等－上有差異 ^[18] ；
• 人?特徵傾向會似自己?父母（遺傳），但又好少可會同父母完全一個板 ^{[19] [20]} ；
• 有一?特徵－例如係 ?痕 ?－係無論如何都?能?由父母直接傳?仔女?；
• 上述?現象?第? 動物 以至 植物 身上都可以觀察得到。

由??簡單?觀察?度，可以作出以下? 假說 ：是但?任何一隻 生物 ，?會由父母身上繼承一??（???就係所謂? 基因型 ^{[e 7]} ），???會對?最後?整體特徵（ 表現型 ^{[e 8]} ）有深遠?影響，但後天得到?特徵（例如?痕）似乎多數都?會影響返基因型轉頭，所以?會直接由父母傳?仔女。上述?假說??世紀初引起?學界一個疑問：特徵係點樣由父母傳去仔女?度??？對於?個問題， 生物學界 ? 1940 至 1950 年代做??究表明， DNA 正正就係?遺傳過程發生?媒介，而?個重大發現定立?現代 遺傳學 ?基礎 ^{[21] [22]} 。

基因組

基因組 最基本?單位係 ?基對 ^{[e 9]} ：一條 DNA 分子 由一排排成雙成對? 核?酸 （ ^{[e 10]} 蛋白質 ?一種）組成，後者可以有四個?同款－ C、G、A、T －??款?配對同排列會影響到隻生物體內蛋白質??生等? 生命 過程，而??生命過程會影響隻生物?特徵（例： 肌肉 就係由蛋白質組成?，所以影響身體?蛋白質?生就會影響隻動物?肌肉?粗幼）；??配對同排列?隻隻生物入面都?同，所以 物種 同物種之間同埋個體同個體之間會?特徵上有差異 ^[22] 。

基因組?分層結構如下 ^{[註 3]} ：

• 一條 DNA 分子 上?每個 基因 ^{[e 11]} 都可以由若干對?基對組成：隻隻生物?基因組入面似乎都有一??基對係?用?，而且一個遺傳特徵可以係由好幾對?基對一齊決定?，一個 基因 係指一條 DNA 分子入面某?一齊做某個功能??基對。
• 如果有某段 DNA ??同個體入面?有幾個?同款，???同款就係彼此? 等位基因 ^{[e 12]} 。
• ?一隻生物? 細胞 入面，?一條條? DNA 會聚埋一齊形成 染色體 ^{[e 13]} ?結構 ^{[23] [24]} 。
• 一隻生物體內所有?染色體加埋?總體就係?? 基因組 ^{[e 14] [25]} 。

?個例說明，人?基因組由 23 對（46 條）染色體組成，? 23 對染色體? DNA 分子上面總共有成超過 30 億對??基對；每一對?基對都可以係 CG、AT 等??同款，所以有好多個可能?組合；是但?兩個人，??身上??基對有 99.5% 都係一樣? ^[26] ；之但係 30 億? 0.5% 都仲係一個好可觀?數字，所以人與人之間有?細?個體同 種族 差異 ^[27] 。如果一條 DNA 上面有某一段入面??基對會一齊做某個特定功能（例如係決定頭髮?色水），???就?止「一個基因」。人類?頭髮色水可以有黑、紅、同埋棕幾款，而「 黑頭髮 ?基因」同埋「 金頭髮 ?基因」就係?段 DNA ?等位基因 ^[28] 。

定義進化

基因組?理論思考上可以?? 定義 進化：隨住 時間 過去，一班生物?基因組會（因? 物競天擇 等?原因）一代一代慢慢?變，而某?等位基因可能會完全取代其他等位基因又或者消失－例如有某?表現型特徵可能好?到班生物生存同繁殖，令到同?相關?等位基因?幾代之後就完全支配?個物種? 基因庫 （ ^{[e 15]} 指個 族群 身上帶?所有基因），又或者因?個特徵太過??生存（例如有個基因會?到個個體 不育 ）等?原因所以好快消失?。亦?係話??個過程入面，某?基因?個物種?基因庫入面出現?頻率會慢慢變化，而?個就係進化? 操作定義 （實際?科??陣用?定義） ^[29] 。

數學 化???，進化?過程可以?樣?想像：?是但一點時間點?個基因 ${\displaystyle g_{0}}$， ${\displaystyle g_{0}}$ ?第 ${\displaystyle i}$ 個複製品叫 ${\displaystyle g_{0i}}$， ${\displaystyle g_{0i}}$ 傳到去下一代基因庫 ${\displaystyle x_{1}}$ ?度? 機會率 會?等同於?一個基因?一個複製品（ ${\displaystyle g_{1i}}$），?係

${\displaystyle \Pr(g_{0i}\subset x_{1})\neq \Pr(g_{1i}\subset x_{1})}$^{[註 4]}

例如係好出名? 樺尺? ^{[e 16]} ?：樺尺?係一種 飛蛾 ，本來係白色帶黑斑點?，不過? 18 世紀 工業革命 ? 英格蘭 ， 工廠 排出大量黑色?廢氣，引致樺尺?族群?色水有所改變－ 生態學家 發現?工業革命?兩個世紀期間，英格蘭樺尺??色水變到黑???色。根據生物學家??究，?個現象?原因如下－樺尺??身體色水係由等位基因話事?，隻隻樺尺?身上都有決定?身體色水?基因，而「白色帶斑點?基因」同埋「黑色?基因」係?個基因?等位基因，?英格蘭樺尺?由白色帶斑點變成近乎全黑?色水?過程當中，「黑色?基因」??個族群?基因庫入面出現?頻率提升?（黑色身體??染得勁?環境?度起到 保護色 作用），而「白色帶斑點?基因」?出現頻率就相應跌?－?定義上就係一個進化?例子 ^[30] 。

上：未經工業革命?樺尺? 樣本 ；
下：工業革命後?樺尺?樣本 ^{[註 5]} 。

按照?個定義，進化有得按時間尺度同差異程度分做 微進化 ^{[e 17]} 同埋 宏進化 ^{[e 18]} 兩種：

• 想像一個族群，???基因庫會一代一代?變；?（例如）10 代之後，個基因庫變到有些少?同?樣，不過第 10 代?個體同初代個體之間?差異仲未算明顯（基因決定特徵），? 生物分類 上仲算係同一個物種，?種?相對短?時間之內發生、未至於令個生物族群完全變成第個物種?進化就係所謂?微進化，例子有正話提到樺尺?族群整體?變色過程 ^[31] ；
• 而家想像個族群一路進化落去，?（例如）過? 10,000 代之後，第 10,000 代?個體同初代個體之間有?極大?差異（基因決定特徵），經已算係兩個?同?物種，?種?長時間發生、會令個生物族群完全變成第個物種?進化就係所謂?宏進化，例子有由原始? 靈長目動物 進化成 人類 ?過程 ^[32] 。

有性繁殖

遺傳係 繁殖 ?一部?：

• ?原始? 無性生物 當中，基因會直接由母體傳去後代?度－好似係細菌?住一變二、二變四?? 分裂 ，出?後代係完全同母體一個?印?。
• 而?好似人等? 有性生物 當中，繁殖需要兩個個體（父母）－? 有性繁殖 ^{[e 19]} ?過程，父母?度會各自發生 細胞分裂 ^{[e 20]} ，雙方都會各自?一?基因出?，而且?個過程當中父母?出?基因仲會獨立分別?洗牌；?人同其他 哺乳類 入面， 性染色體 ^{[e 21]} 係繁殖?關鍵，人 男性 ?性染色體係一條 X 染色體 同一條 Y 染色體 ，而人 女性 ?就係兩條 X 染色體；?繁殖?過程?度，父母會各自將自己?其中一條性染色體傳?個仔女，而?個過程會決定個細路? 性別 ：如果阿???自己條 Y 染色體?話就會生仔，而如果???自己條 X 染色體?話就會生女。性染色體將阿??基因型同阿??交?仔女，所以仔女通常都會有?似阿?又有?似阿?，但?會同是但一個完全一個?印，而且?個過程度仲會有少量?洗牌效應，會影響邊個等位基因同邊個等位基因?埋一齊 ^[33] ，令到???仔女身上?等位基因會係父母等位基因?新組合 ^[34] ，所以通常 兄弟 ?會完全一樣樣， ?妹 都?會完全一樣樣 ^[35] 。

有性繁殖係一把雙面刃 ^{[36] [37] [38]} ：首先，有性繁殖效率相對低，? 兩性有明顯差異 ?物種（例如係人）?度，父母淨係得一方可以 ?仔 ；而且?有性繁殖生下一代?個體淨係有得將?一半?基因傳?下一代，再過多兩代就得返?八分之一；雖然有性繁殖理論上有缺點， ?核生物 ^{[e 22]} 同 多細胞生物 ^{[e 23]} 比較多係行有性繁殖?。?一世紀生物學界一般認?原因在於有性繁殖令一個族群內部有返?上下 多樣性 ：就?複製母體? 無性繁殖 創造出??後代同母體一個板；相比之下，有性繁殖當中?基因洗牌過程令一個物種?基因庫更加多樣化，好多時會令到進化?過程更加快 ^{[39] [40]} ，而?一點可能會令個物種更加有能力適應係?變?環境－如果一個物種?個體全部都係?無性繁殖生?後代，個物種繁殖?陣就會少?「?同個體?基因溝埋同重新組合」?個步驟，????基因多樣性就會低得好交關－???個體個個都差?多樣，爭?資源都一樣，?一發生起???天然災害，資源短缺起上?就好容易會一?過死? ^{[41] [42]} 。

機制

進化定義係指一個 族群 ?基因庫隨時間演變?過程：當某個 等位基因 ?個物種?基因庫入面出現?頻率變?陣，進化就發生?。 進化機制 ^{[e 24]} 係指引致基因庫一代一代?改變?原因。根據?一世紀?進化論，進化機制主要有以下?? ^[43] ：

物競天擇

物競天擇 ^{[e 25]} 係由達爾文??本名著《物種起源》?度提出?。「通過物競天擇進行?進化」係指某?等位基因因?有利於生存同繁殖而變得更加常見?過程。例如身上帶有「 抗藥能力 勁?基因」?細菌個體比較能?生存落去同埋繁殖，所以?下一代入面「抗藥能力勁?基因」?個等位基因就變得更加常見。?個機制成日?人話?係 不證自明 ?，因?個機制係三個簡單事實?必然結果 ^[44] ：

• 表現型 差異 ：就算係?一個族群?生物入面，個體彼此之間?形態、生理、行?等各方面（表現型）有所差異；
• 適應能力差異 ：?同?表現型特徵對於生存同繁殖?影響都?同，例如「 皮下脂肪 厚」對於?凍?地方生存有利，而「 不育 」對繁殖不利；
• 適應能力?遺傳度 ：??影響適應能力?表現型特徵受基因影響，有?甚至完全由基因話事?，所以有得一代傳一代。

?野外，好多時「生?出??下一代」數量大過「有得生存落去?下一代」，而??原因令到同一個物種之間?個體會爭生存所需?資源（例如係爭 ?食 ）同埋繁殖?機會（例如係爭伴侶）。???競爭?度，某?個體因?先天優勢所以比較大機會爭?，好似係天生大隻?聰明?所以比較擅長??食，或者天生個樣??所以比較容易?到伴侶，於是乎??有先天優勢?個體同??有優勢?比起上?，會比較有能力生存同繁殖－將自己身上?基因傳去下一代?度 ^[45] 。

進化適應度

物競天擇帶出? 進化適應度 ^{[e 26]} ?個?念。一隻生物?進化適應度係指?生存同繁殖?能力，而?個能力決定?有幾大 機會 將自己身上?基因傳去下一代。某隻生物?進化適應度係以「比例上有幾多後代帶有?自?隻生物?基因」? 量度 ? ^[46] ，所以進化適應度?係齋??可以生到幾多個後代?－就算?生到?仔女?數量係同類個體?十倍，如果??仔女因?太虛弱或者??識照顧等?原因而生存?到，?隻生物?進化適應度都?會好高 ^{[44] [47]} 。

一個特徵（或者等位基因）?進化適應度?係定死??變?。如果個族群住?環境變?，本?係中性或者有害?特徵可能會變成有利?特徵，反之亦然 ^[48] ，例如係頭先講??樺尺??例子?樣，?一個乾淨?自然環境?度，生到成身黑色會令到隻?變得更加樣眼，更加容易??獵食者?到同捉?食，但?工業革命?陣，?工廠噴?好多?染物出?，?到??住?地方好多都變?黑????色，??個環境當中，「成身黑色」反而變?做個有利?特徵，令到隻?變得??樣眼。地球一路都有好多 地殼 活動、 氣候 同埋 洋流 等??令地球?環境不斷?變化，而??變化令到地球上?生物要係?進化?適應新環境，亦都令地球? 生物多樣性 ^{[e 27]} 變得更加高 ^[49] 。

物競天擇可以大致上?用以下? JavaScript 碼 ? 模擬 ^[50] ：

var
 p
;
 // 基因 P ?個族群當中?出現率

var
 N
 =
 2000
;

var
 generations
 =
 200
;

var
 data
 =
 [];

var
 simulations
 =
 10
;


// 定義??子程序先。

function
 next_generation
(
simulation_data
)
 {
 // ?個子程序負責由一代?數據計下一代?樣

    var
 draws
 =
 2
 *
 N
;

    var
 A1
 =
 0
;

    var
 A2
 =
 0
;

    for
 (
var
 i
 =
 0
;
 i
 <
 draws
;
 i
 =
 i
 +
 1
)
 {

        // p 乘?數?代表基因 P 有幾有利生存繁殖，?個數?愈高愈表示基因 P 有利生存繁殖。

        if
 (
Math
.
random
()
 <=
 p
 *
 1.01
)
 {
 // ??個個案入面，0.5 * 1.01 大過 0.5，所以 A1 ?數?比較有可能上升。

            A1
 =
 A1
 +
 1
;

        }

        else
 {

            A2
 =
 A2
 +
 1
;

        }

    }

    p
 =
 A1
/
draws
;
 // 將 p 設做一代後，基因 P ?個族群當中?出現頻率。如果 p 上面乘?個數大過 1，? p ?數?傾向會升。

    simulation_data
.
push
(
p
);

}


function
 simulation
(
simulation_counter
)
 {
 // ?個子程序負責做模擬。

    p
 =
 0.5
;
 // 設 p 做 0.5，?係個族群入面一半個體有基因 P。 

    for
 (
var
 i
 =
 0
;
 i
 <
 generations
;
 i
 =
 i
 +
 1
)
 {
 // 行 200 代（設? generations = 200）。

        next_generation
(
data
[
simulation_counter
]);
 // 行 next_generation ?個子程序，行 200 次。

    }

}


// 個主程序??度。

for
 (
var
 i
 =
 0
;
 i
 <
 simulations
;
 i
 =
 i
 +
 1
)
 {
 // 做 10 次模擬（設? simulations = 10），

    data
.
push
([]);
 // 每次都將計出?數據放入 data[] ?個 array ?度。

    simulation
(
i
);
 // 行 simulation ?個子程序。

}

draw_line_chart
(
data
,
"Generation"
,
"p"
,[
"Population Size:"
,
N
,
"Generations:"
,
generations
]);

// 最後?條線，以 X 軸表示代，Y 軸表示 p；如果「p * 1.01」當中 p 乘?個數大過 1，通常條線會係一條有好多起起跌跌、但總體偏升?線。

人工選擇

人工選擇 ^{[e 28]} 同物競天擇一樣，都係一個物種入面「有?個體有得生存繁殖、有??」而令個物種?基因庫一代一代?變樣。同物競天擇?同?係，?人工選擇當中，負責揀「邊?個體有得生存繁殖」??係大自然，而係人：?人?歷史裏面，人有 養 好多?同種對??有用?動物，好似係有得??看門口同 打獵 ? 狗 、用?捉 老鼠 ? ? 、用??手 耕田 ? 牛 、用?騎同拉車? 馬 同埋用?食? ? ??。人好多時都有能力主宰??養?動物?生存同埋繁殖－就自然有得決定??所養?個體入面邊?有得將自己?基因傳?下一代。?種機制就係所謂?人工選擇 ^[51] 。

人工選擇一個出名?例子係 比利時藍 ：?個品種? 肉牛 身上有種特殊? 基因變異 ，個變異令??生 肌肉 生得好勁（而牛肌肉係最好賣? 牛肉 之一），同時亦都?到??? ? ? 生?道 變窄?，成日都要?開刀先至成功生到仔。?種牛如果擺?自然環境?度，應該會?能力自己正常?繁殖，好快會 ?種 ，但?種牛係由人養?，而???好肉令??好有 經濟價? ，亦都令到? 牧場 肯?錢???開刀生仔－?種?自然環境?度?能力成功生存繁殖?動物，?人養?環境之下因?人?選擇而有得生存繁殖，所以就係人工選擇?一個例子 ^[52] 。除?比利時藍之外，動物?人工選擇而進化?過程?牧場或者係 寵物 配種 當中日日都發生緊 ^[53] 。

基因突變

基因突變 ^{[e 29]} 係指一個細胞?基因組?某段 DNA 突然有變化。當有一段 DNA 變?樣，相應?基因會有變化，可能會?到個細胞?能力繼續做?做開?個功能，而如果?個細胞屬於一隻 多細胞生物 （例如係人類），隻多細胞生物可能會受害，例如一個人隻 手臂 ?肌肉細胞突變，可能會?到?肌肉喪失功能，而?點會對個人?生存造成危害。根據對 黑腹果蠅 ^{[e 30]} ??究，如果一個突變令某個基因所?生?蛋白質有所改變，?個突變通常（70% ?情況下）會係有害?，而?淨低?情況下，個突變就會係?影響或者有些少好處? ^[54] 。

DNA 上好多時會有複製?幾次?基因，而??「多?幾?出?」?基因被指係有利於突變?發生 ^{[55] [56]} ：?好多生物物種? DNA 當中都會有「做同一樣功能?基因多?幾?」?情況，例例如係?人 DNA 負責整 眼珠 ?基因當中，有 4 個基因係用?整感光結構?，而有 3 個基因整 視錐細胞 同 1 個基因整 視桿細胞 ，而??基因本來都係由一個基因演變出?? ^[57] ；想像家陣有個基因因?突變而壞?，做?到?原有?功能，但條 DNA 上有?個基因?複製品，??複製品就可以做埋?個基因??，等隻生物?會因?突變?到?做?到某?對生存繁殖?講必要?功能－「一個基因多?幾?」可以間接令「?突變?進化」?家?對個體以至成個物種?講風險??高 ^{[58] [59]} 。除此之外，第?類型?突變仲可以由本來?用? DNA ?度變?全新?基因出? ^{[60] [61]} 。

新基因??生可以涉及由幾個基因?度每個切一截出?再組合 ^{[62] [63]} 。??個過程入面，每個基因?功能?某一部?會???出?再組合埋一齊做一個新功能－雖然?個新功能?一定有用或者有益 ^[64] 。

基因流動

基因流動 ^{[e 31]} 係指同一個物種?同族群之間或者物種之間交流基因?過程，係一個族群或者物種?前所未接觸過?基因?一種方法：一個族群?個體可以搬去第?同物種?族群?度住，?且同新族群?個體交配同生下一代－人就成日都做?樣?，好似係 移民 去第個國家，?手??度落地生根同埋同當地人通婚。除?人之外，?同一? 大陸 ?度? 老鼠 都可能分做好多個族群，而?老鼠耐?耐就會?遷徙，造成?同老鼠族群之間?基因流動 ^[65] 。

上圖係基因流動?抽象圖解；想像家陣有兩個族群（?同?色）? 甲蟲 ，??兩個群體?座山隔開?，箭咀表示基因?傳遞，右邊族群具有令到隻蟲深色? 等位基因 ，而右邊族群入面有隻個體遷徙去左邊族群?度，??度?到伴侶生後代，令左邊地區首次有?隻深色?甲蟲。?埋 顯性 。

物種之間?基因流動會涉及所謂? 橫向基因轉移 ^{[e 32]} －?係一?基因由一隻生物傳去?一隻?係?仔女?生物?度。?種事通常?細菌入面先至會發生 ^[66] ，而且仲會?到 醫學 方面??究者好頭痛：一個物種?細菌?? 藥 殺到?上下會開始 抗藥 －因??抗藥能力?個體話?快就死?，淨返?抗藥能力勁?個體先會生存到落?，?手??抗藥能力勁?個體會繁殖，（抗藥能力係受基因影響?）生一?同??一樣抗藥能力勁?下一代出?，最後成個物種變到抗藥能力愈?愈?。除??，細菌仲有可能做橫向基因轉移將自己?抗藥基因傳?第?物種?細菌，?到成?細菌物種都變到有抗藥能力 ^[67] 。

基因漂變

基因漂變 ^{[e 33]} 係指一個等位基因?一個族群入面出現?頻率因? 抽樣誤差 ^{[e 34]} 而有所改變?過程：有性繁殖?父母基因洗牌過程（?係由阿??度抽一半、由阿??度又抽一半）係帶有些少 隨機 ?－就算一個等位基因?適應度?差過第?等位基因，個基因都可能會?「抽基因」過程當中??抽?到?傳落去後代?度，?到??出現頻率?兩代之間有隨機性質?下降 ^{[68] [69]} 。

數學化??講，可以想像上圖，X 軸代表時間，而三條?同色?線分別代表三個描述緊一個 隨機過程 （例如進化）? 變數 。隨機過程本質上就會有 誤差 ：例如 ${\displaystyle x_{t}=f(x_{t-1})+e}$，當中 ${\displaystyle x_{t}}$ 指?時間點 ${\displaystyle t}$ ? ${\displaystyle x}$ 數?（例：?時間點 ${\displaystyle t}$，某等位基因?基因庫入面?出現頻率）， ${\displaystyle f}$ 係一個特定? 函數 （反映 ${\displaystyle x_{t}}$ 點樣受到 ${\displaystyle x_{t-1}}$ 影響），而 ${\displaystyle e}$ 係帶有隨機性質?誤差?；條線會有好多相對細幅度?上上落落。

基因漂變淨係會?兩種情況之下停止：一係個等位基因完全?個物種?基因庫?度消失（例：個族群完全??金頭髮?個體），一係個等位基因完全取代?第?等位基因（例：個族群淨係得返金頭髮?個體）；如果以上兩個情況?發生，?一個等位基因?出現率??同世代之間實會有些少上上落落。同時，如果有個屬同一個物種?族群（例如係人）因?遷徙等?原因而分開做兩組各自獨立發展，就算??各自本來?基因庫同埋新環境完全一樣，兩組?好幾代之後?基因庫都梗會有些少?同 ^[70] 。

效果

進化會影響一個生物 族群 每一方面?特徵：基因左右一隻生物身體?蛋白質?生，所以會影響隻生物?外型同身體功能；除此之外，進化仲有可能改變一個物種? 行? －蛋白質?生會影響 神經系統 ?結構同 生理 ，而 神經科學 上??究表明?，神經系統?結構同生理特性主宰一隻動物?行?同 心理 特徵 ^[71] ，例如?人身上做??究就發現， 智商 （IQ）相當大程度上係受遺傳因素主宰? ^[72] 。進化造成?各方面改變會影響一個物種?生存同繁殖，亦都會影響到???進化適應度，主要會有幾個效果：

適應

適應 ^{[e 35]} 指「一個物種慢慢?變到更加適合????環境?度生存同繁殖」?一個過程 ^{[73] [74]} 。好似?正話提到? 樺尺? 例子?，樺尺?族群整體?講變成黑????色水，?點令??更加能?匿埋?周圍黑???環境?度，更加擅長避開 獵食者 同生存落去－而?樣主要係因? 物競天擇 ?過程，白???色?樺尺?更加容易?獵食者擔走，而後者??生存到落?，淨係得黑色樺尺?有得繁殖，所以??更加大 機會 將自己?基因（包括「令??黑???色」?基因）傳?下一代，於是「黑???色」? 等位基因 出現頻率上升，令到個物種變到多數都係黑????色水。?種「透過進化變到更加適合?環境?度生存同繁殖」?過程， 生物學家 ?好多個細菌、植物同動物物種身上都有觀察得到 ^[75] 。

• 
  巴基鯨 ^{[e 36]} ?重組圖 ^{[註 6]} ；??係現代鯨魚?祖先，有?。

• 
  ?一世紀?鬚鯨棚 骨 ；?鬚鯨進化史當中，??對前?（a 同 b 兩?骨）變?做?，變得更加擅長游水。

?進化適應?過程入面，一個族群?已有身體結構會慢慢?變 ^{[77] [78]} ，??可能會得到一?新特徵，又或者失去某?已有特徵。好似係 鬚鯨 ?進化史?，對 化石 等證據??究顯示，鬚鯨?遠古祖先（可以? 巴基鯨科 ）係有 ? ?陸上動物，後?因?某?原因走?去近 海 ?地方住，甚至乎開始 游水 （?捉 魚 食或者避開一??識游水?獵食者）；打後???後代??就愈?愈變到似 ? ，令到??變得更加擅長游水（同時失去?陸地上面行?能力） ^[79] 。同樣?適應過程? ?? 身上都見得到：??對翼?骨架同 老鼠 ???骨架有好多相似?地方，而?究亦都顯示??同老鼠有某? 共同祖先 ^{[e 37]} ，但兩者打後就分開各自進化 ^{[80] [81]} 。

痕跡器官

?進化適應?過程當中，某?身體結構可能會失去原有功能，但又未完全消失得?，變成所謂? 痕跡器官 ^{[e 38] [82]} 。好似係 ? 同埋 企鵝 ???曉飛? 鳥類 ?樣，?實???祖先有好?壯? 翼 ，而且??有好多現代近親物種都曉飛，但?同企鵝已經?曉飛（雖然企鵝進化到好擅長游水），淨係得返對又?力又飛?起、但仲未消失??翼 ^[83] 。除??，痕跡器官例子仲有一?? 黑暗 環境生活，進化到得返對盲眼?魚類 ^[84] 同埋係明明經已??但係仲有 盤骨 ? 鯨魚 同 蛇 ?? ^[85] 。人亦都有?好似係 智慧齒 等?痕跡器官 ^[86] 。

Info：「退化」

由痕跡器官??念當中?得到，進化通常會令到一個族群?生物整體上變得更加擅長?住緊個環境度生存同埋繁殖，但?一定會令到??變得更加「高等」或者「複雜」：頭先鬚鯨同?等?例子就係?，進化好多時係透過「失去某??」?令個族群更加適應到環境?－鬚鯨????進化過程?度少?對?，?樣?係令到??行?到路，但同時令到???身體?使生?，空??資源出?，可以更加專注於將身上? 營養 用?組成游水用??，令??游水??，總體更加適應到?海入面生活 ^[87] 。

因??，專業?生物學家?會用 退化 ^{[e 39]} ?隻詞－「進化」?生物學?定義上純粹係指 一個族群?生物?基因庫有改變 ，??基因上?改變可以引致班生物?身體多??新??，或者少???舊??，而兩種情況都有可能?到班生物適應??住緊?環境。「退化」?隻詞?出現純粹係因?一般人同 大?媒體 對進化論?誤解，以?一種生物進化就實要係「多???」或者「變得更加高等」 ^{[註 7] [88]} 。

亦可以?? 定向進化說 同 目的論 等已經?現代生物學界否決???法。

物種形成

物種形成 ^{[e 40]} 係指「本來同屬一個物種?族群分開，?且各自獨立發展做兩個或者以上?同物種」?過程 ^[89] 。

物種?念

物種 ^{[e 41]} ??一世紀初?生物學界都仲係一個有些少爭議性??念。最基本上，物種可以用交配?定義?，?係所謂? 生物物種?念 ^{[e 42]} ：??個定義下，一個「物種」?生物指?係一個或者多個族群?生物，而??族群係 ^[90]

1. 有能力同對方配種－指正常?異性個體有能力同對方交配?且生出有繁殖能力?後代；而且
2. ?繁殖上同其他族群分開?。

例如係 人類 ?個族群?， 白種人 同 黃種人 －又或者 日本人 同 漢人 、又或者 ?人 同第? 漢族民系 －之間有住血統同埋外型上?差異，但??之間有能力配種（白人同黃種人通婚可以生到有生殖能力?後代出?），而?幾個族群都係?能力同人以外?生物配種?，例如一個人－無論?係邊個人種都好－同一隻 馬 交配?會生到???後代出?，所以人類係一個同馬?同?物種 ^{[91] [92]} ；又例如係 獅虎 ?，公? 獅子 同?? 老虎 交配可以生到獅虎?種動物出?，但獅虎幾乎係一定?生殖能力?，所以獅子同埋老虎?生物學界先會?人當做兩個?同?物種?? ^[93] 。

形成機制

物種形成主要有兩大機制： 異域型 ^{[e 43]} 同埋 同域型 ^{[e 44]} 。異域指多過一個族群?生物受地理上?隔離而由同一個物種變成多個?同物種?過程 ^[94] ，例如係因?遷徙等?原因同一個物種分開做幾組，搬去?同?地方度住，再分別?適應各自?環境而進化，如果??要適應?環境?同或者有明顯? 基因漂變 ， 進化到?上下 ?幾組之間?差異會大到?能力同對方配種－變?做?同?物種。?種分化?人身上都?得到：各個人種? 膚色 等特徵因?住?環境?同而進化到?一樣，只不過係人仲未分化到?能力彼此之間配種，所以仲算係同一個物種 ^[89] 。如果將異域物種形成?過程?做抽象化?圖解（色水表示基因庫?特徵）：

• 
  Original population－原初族群
  Geographical barrier－地理分隔
  Reproductive isolation－繁殖上?分離

?一方面，同域物種形成係指有個新物種去到某一個環境，同一個固有物種?同一個地區度住，但因?繁殖或者溝通等?行?差異而同?到對方配種，最後兩者分化到變做兩個?同?物種，例如係 印尼 就有一種 ?? 因???之間把聲有差異，而且??係?認對方把聲??伴侶?，?到???生?幾個把聲?同?族群。?幾個族群仲要拒?同其他族群交配，最後?生?三個從來都未雜交?族群 ^[95] 。如果?做抽象化圖解?話：

• 
  Original population－原初族群
  Isolation－（因?地理以外?因素造成?）分離

同域物種形成可以再細分做兩種： 近域型 ^{[e 45]} 同埋 ?域型 ^{[e 46] [89]} 。近域物種形成指一個族群地理上同原本?族群隔離?，打後因??個新族群擴大而同本??個族群有接觸，但??個時候兩個族群?差異經已大到配?到種－變?做兩個?同?物種 ^[96] ；?域物種形成指?係一個族群分?個細族群出?，而?個細族群搬?去就?旁邊?地區度住，雖然兩個族群?地理上相連，但係某?交流上?困難?到??最後分化?做?同?物種 ^[97] 。

• 
  兩隻?自?同地域?黑脊鷗
• 
  黑脊鷗?居住地分佈；??被指有種情況，係相?地區?黑脊鷗族群先至有能力同對方配種。

最出名??域物種形成例子係 環狀物種 ^{[e 47] [89]} 。環狀物種係生物學上一個廣受討論?進化現象：一?族群分別?住?一?相??區域?度，因?上述?進化過程令到??當中地理上離對方愈遠?族群（遺傳上）愈係同對方?同，而相??族群之間?相似度高到足以同對方配種，但?相??族群就做?到?樣?。住? 北極圈 ?頭?各 黑脊鷗 ^{[e 48]} 族群就被指有??情況 ^{[98] [99]} 。

?念衝擊

環狀物種等?現象反映出「物種」之間?分界?實係有些少含糊?。?進化?過程入面，一個族群係慢慢?變樣?，由一個物種進化到變成第個物種（ 宏進化 ）?過程?係一?就變出?，而係慢慢逐?逐??變?，所以同一個族群入面兩代之間實有配種?能力，世代同世代之間?差異?係「一係就似一係就?似」，而係「有幾似」：

• 一般?講，假設???好勁?突變，第 1 代同第 10 代之間?差異會大過第 1 代同第 2 代之間?；
• 而第 1 代同第 100 代之間?差異又會大過第 1 代同第 10 代之間?。

如此類推，個族群慢慢?變?變?，（譬如）可能去到第 500 代，??先會同第 1 代差異大到?能力配種，之但係??個情況?度，第 250 代同第 1 代有能力配種，而第 250 代又有能力同第 500 代配種。因??，對於進化??究令到科學界理解到一點：?同?生物「物種」之間?實?話有??完全明確?分界線 ^{[註 8]} ，而物種?個?念到??一世紀初，科學界一般都當?只不過係一種??溝通方便?用詞，而?係一個嚴謹?科學?念 ^{[100] [101]} 。

?種

?種 ^{[e 49]} 係指某一個物種或者屬某個 生物分類 上?族群成個消失：當有一個物種，??最後淨低?個個體都死埋?一刻，?個物種算係??種 ^[102] 。

?種?生物進化史上面?係???出奇?事，而係係?不斷發生緊?。事實係據?計，地球上曾經存在過?物種當中?大多數?都經已??種，而且地球上曾經發生過好多次生物大規模?種?情況（?係所謂? 集體?種 ），集體?種多數係源於地球?環境－尤其係 氣候 －突然之間變得好犀利，?到有好多生物族群??切進化去適應新?環境，?且因??而死? ^[103] 。最嚴重?五次集體?種分別係發生?

• 奧陶紀 後期（4 億 4 千萬年前）、
• 泥盆紀 後期（3 億 6 千萬年前）、
• 二疊紀 後期（2 億 5 千萬年前；大約 95% ?海洋生物同 70% ?陸地動物?見?）、
• 三疊紀 後期（2 億 1 千萬年前）、同埋
• 白堊紀 末期（6 千 5 百萬年前）。

當中? 白堊紀-古近紀滅?事件 ^{[e 50]} 因?涉及到 恐龍 ??種而好出名 ^[104] 。除此之外，?一世紀初??究指，當時生物物種?種?速度係正常速度? 100 到 1,000 倍，據?計主要係因?人?各種活動?染?地球環境 ^{[105] [106]} 同埋 全球暖化 ?現象 ^[107] 。

證據

生物學 同第? 科學 領域一樣，會?足 科學方法 ?做 ?究 。?講意思?係話，生物學界會根據手上已知係?? 事實 ，?一? 理論 出?解釋?究緊?現象，然後? 邏輯 ?思考，去????理論會做點樣?預測，?手做 實驗 同 觀察 ?? 數據 ，驗證?個理論?預測係??確 ^[108] 。根據?世紀?生物學?究，進化論?一個理論得到?自多個源頭?證據支?，大致上有兩大流：

微進化?證據

微進化 係指一個物種內部?短時間內?基因庫變動，變動?幅度未至於令最新?代成?新?物種（最新?代同原初?代仲有能力配種）。微進化可以輕易? 觀察 得到：生物學家可以由野外?動植物?度 抽樣 ，???同?動植物物種基因庫會點樣隨時間變化，再????基因上?變化會同?動植物?特徵有?? 相關 ，而???究的確發現?野生動植物之間會有微進化?現象 ^{[109] [110]} 。

除?觀察性質??究，生物學家仲有得做實驗： 實驗 係用科學方法?驗證 科學理論 ?手法之一，指做?究?人主動?對?究緊?現象作出一?操控，再??個操控會?生點樣?結果（以及係個結果同理論所預測?有?出入）。 哈佛大學 就曾經做過一個??實驗驗證微進化：

• ?究人員將 大腸桿菌 ^{[e 51]} 擺?個缸入面養，?個缸愈近中間?地方就放?愈高 濃度 ?抗生素?度－抗生素會殺死大腸桿菌，所以只有對抗生素抵抗力勁?大腸桿菌先會能??近中間?地方生存；
• 實驗結果顯示，一如 物競天擇 作?假說所料，?個缸邊緣地區（抗生素濃度低）?大腸桿菌死?去，?手仲繁殖，生到對抗生素抵抗力一代勁過一代，最後仲散佈去到個缸?中間（抗生素濃度最高?忽）

－展示?「一個 族群 ?生物進化，?且變到愈?愈適應自己住?環境」?一個過程。??有關細菌進化??究對 醫學 ?講極之有價? ^[111] 。可以?埋 進化醫學 。

家紅狐狸

?微進化過程?實驗?複雜?? 多細胞生物 身上都做過。例如係相當之出名? 家紅狐狸 ?：? 1959 年， 蘇聯 生物學家 迪米?·貝里葉 ^{[e 52]} 指出，一隻動物?行?係受制於好似 荷爾蒙 同 腦 結構??生理因素?，而??生理因素又係受到基因影響?，所以生物?進化過程會影響到一個物種?行?；??驗證???法，貝里葉?開始?做一個實驗，??一? 紅狐狸 返?，再做以下?步驟?住 馴養 ^{[e 53]} ?? ^{[112] [113]} ：

• 貝里葉將?紅狐狸分做三個等級：第三級?狐狸係最?聽話?，?係??會嘗試走?或者係一有?究人員行近就會攻擊?個體；而第二級?狐狸就係??會??究人員行近同埋???，但?會對?究人員?生明顯好感?個體；第一級?狐狸就係最聽話?批，??個體?單只會??究人員行近同埋???，有陣時仲曉做?尾等?友善動作。
• 貝里葉選擇性?淨係?第一同第二級?狐狸繁殖同生?後代（操控）。
• 後??狐狸一代一代?愈養愈馴，做做?個族群度仲有?所謂?「精英級」狐狸－一?識得主動?同人類接觸?個體，??曉主動行埋去?究人員?度同埋好似 狗 ?聞??陣除；??精英級?個體?一個月大之前已經曉做???（?係顯示?種行??多似係後天學返??）。
• 去到第十代?狐狸?陣，個族群裏面得 18% ?個體係屬於精英級?，去到第?代?陣?個數字就升到去 35%。到??一世紀初，?個實驗仲持續?進行緊，而且個族群裏面已經有成 70% 至 80% ?狐狸係屬於精英級（操控造成?效果）。

?個?究好有生物學價?：??個?究?過程入面，一個族群?生物???究人員選擇，而整體成個族群? 表現型 ?幾代之後出現?明顯改變，顯示?好似狐狸?? 哺乳類 －複雜過細菌好多?生物－都曉進化，而且進化?淨只影響外型同埋某?身體結構，仲可以影響一種生物?行? ^[112] 。除??類實驗，日日都?牧場同埋寵物配種?度發生? 人工選擇 過程亦都?人視?進化過程?實驗證據（人特登操控某??，引致生物?基因庫同表現型起變化） ^{[114] [115]} 。

宏進化?證據

宏進化 指長時間（閒閒地幾百萬年）發生?進化，最後?一代?個體會?能力同初代個體配種。原則上，宏進化難以用實驗??究：宏進化定義上就係發生?（對人?講）極漫長?時間?，如果要做一個宏進化實驗，?究者就要做一?操控，再??個操控?（例如）幾百萬年後?生??影響，?人力物力上根本?可能做得到 ^{[註 9]} ；不過科學家依然?到宏進化? 觀察 性質證據。

古生物學 ^{[e 54]} 係一門以 化石 做基礎?去?究生物物種?生物學子領域：當一隻生物 死亡 ?陣，?條屍會? 微生物 分解而 腐爛 ，?到?生存過?痕跡??。但有陣時，??遺跡可能會因?某?因素而成功?保存到落?－例如一隻生物條屍或者?造成?一?痕跡（好似係 ?印 ?）因?某?特定?原因??得?橋好快??泥土??住?，令到???會?水流等?自然 力 破壞，而??最硬淨?部?－例如係骨頭－就會變成化石留低到落?。有時一?化石仲會保留到成隻生物，例如係? ? 雪住?? 長毛象 同埋一?? 琥珀 封住? 昆蟲 ?? ^[116] 。?究者可以用 放射性定年法 ^{[e 55]} 等?技術????到?每個古生物樣本年代有幾久遠，???得知?同地區?生物?形態上點樣隨時間變化 ^{[117] [118]} 。

• 
  有隻 蟻 ?入面?琥珀
• 
  一?有恐龍?印?上面?化石
• 
  始祖鳥?化石

??好多?自古代生物?痕跡令生物學家有得?到?同 地質時代 ?生物係??樣，而且仲係進化?直接證據：自從達爾文?陣時開始，古生物學家發現?好多??之前未見過? 過渡化石 ^{[e 56]} －??化石顯示?現有生物物種同???遠古祖先之間??過渡形態，例如係好出名? 始祖鳥 ^{[e 57]} ，就係由某?恐龍?度進化出現代鳥類?證據－始祖鳥?大約 1 億 5 千萬年前存在過，由??身體構造好明顯?得出，?有?似恐龍又有?似現代鳥類，而且?後期??化石?度仲?到?種生物?後代慢慢?演變到愈?愈似現代鳥類，支??宏進化?假說 ^{[119] [120]} 。

進化論史

《物種起源》前

?最廣義上，進化論可以泛指「描述生物物種一代一代?變化?學說」。?種學說歷史?實相當悠久：早? 古希臘 ?陣，經已有學者?度討論?類似現代進化論??頭，好似係 蘇格拉底 ^{[e 58]} 打前就有古希臘 哲學家 主張話一種生物可以係由第種生物?度?? ^[121] ，而打後少少? 古羅馬 哲學家 盧克萊修 ^{[e 59]} ??本《 物性論 》 ^{[e 60]} 入面都有提??類似進化論??法 ^[122] 。

不過?打後?超過 1,000 年， 西方世界 由 目的論 ^{[e 61]} 主導： 阿里士多德 ^{[e 62]} 提出，?淨只係生勾勾??－?所有大自然???講，進化係大自然各種可能性?一種?完美?呈現。?提出?好似係 理型 同物種等??念。而?個亦都係?個 自然目的論 ?一部分：?認?一切?事物存在?目的都係要?某?「神聖? 宇宙 秩序」入面發揮一?作用，所以各種生物有親???特徵都係因?某?「冥冥中?主宰」?意願。? 中世紀 ? 歐洲 ，?種「宇宙有某?神聖秩序」?思想?變體做??時各 基督? ?派?標準知識，而??心目中掌管住宇宙秩序?主宰就係??? 上帝 ^[123] 。

?種思想要去到成 17 世紀先至開始?人挑戰：當時新興起?現代 科學方法 要求對自然現象?解釋應該建基?觀察得到?事物上面，要遵守共同? 物理定律 ，而?好先假定?有某?神聖?宇宙秩序?背後，就算信上帝都?好假定?人完全了解上帝?意願。好多同期學者仲係堅持舊?見解：例如 英國 博物學家 莊·里 ^{[e 63]} 就提出?「物種」?個詞語，?且主張每個物種都有某??會隨住時間變?「本質」；而 瑞典 動物學家 林奈 ^{[e 64]} 雖然承認物種之間有分層?關係，但仲係主張???係「?從上帝?計劃」?。?係話??個時期，西方?思想界?主流仲係目的論－?人認?宇宙入面??都係服從一個冥冥中?主宰，而?個冥冥中?主宰係「會??人著想」或者「人有能力了解」?。要再打後?，?種思想先至慢慢?失去影響力 ^[124] 。

《物種起源》後

? 1859 年年底， 達爾文 出版???本名著《 物種起源 》 ^{[e 65]} 。達爾文仔細?講解? 物競天擇 ??法，指出人口增長會引致「生存?爭」，而且?每一代入面都有好多細路因?有限?資源而?去到生殖年齡之前就死? ^{[註 10]} ，??過程令到一個族群?生物入面擅長生存?個體會?上風，而其他?會死亡?且?能力將自己?基因傳?下一代。達爾文??住??推論同埋?? 加拉?戈斯群島 ^{[e 66]} 等地收集返??證據，解釋?好多當時解釋?到?現象。後? 比較解剖學家 湯瑪士·赫胥黎 ^{[e 67]} 仲將?套理論用落去人類?度，運用古生物學同埋 比較解剖學 ?知識提供證據，支持「人類同 類人猿 有共同祖先」??法，奠定?進化論?學術地位 ^[125] 。

初頭?陣， 西人 ?社會大?普遍都覺得?種思想好難接受：??覺得進化論係暗示人?宇宙入面??特殊地位，只不過係?一種動物（?點同西人傳統對上帝?認知?夾）；再加上達爾文等?科學家??「宇宙入面有某?神聖秩序，而??神聖秩序可以??解釋生物點解有某?特徵」?個?法，所以??覺得接受進化論就等如係推 無神論 －而?當時，無神論好多時都?西人覺得係一種 罪 ^[125] 。不過，達爾文?本人去到最後都仲係主張 不可知論 （ ^{[e 68]} 一種中立觀點，?肯定上帝存在，但係亦都?否定?存在），而?認?自己係無神論者 ^[126] 。

除?科學同 神學 上?衝擊之外，達爾文?理論仲打破?西人（同好多地區?人）傳統? 本質主義 ^{[e 69]} 思想：?種思想主張?同「類」??之間係有住某??可以打破?分別?，例如??會覺得「 白人 」同埋「 黃種人 」係兩類本質上?同??，無論一個白人點變個樣，都?可能變到做黃種人。不過達爾文?觀點就指出??種思想?問題：物種同物種之間?明確?分界線，兩個族群或者兩樣?之間?差異?係「一係似一係?似」，而係「有幾相似」－「相似度」?樣?係連續?。例如如果將一個白人?面形同膚色等特徵逐?逐??變，最後係有得慢慢?將?變做一個黃種人?。?種思想上?改革最後令到世人改變???對「 種族 」???念?認知 ^{[127] [128]} 。而到??一世紀，進化論經已廣泛?樣?各領域?科學家用?解釋自然現象同埋製作各種有用?發明，成??做現代科學?可以少?知識 ^{[111] [129]} 。

社會反應

? 19 世紀?陣，尤其係?《物種起源》出版打後?一排，各界?學者對於「進化對於 哲學 、 社會 同 宗? 信仰有??啓示」?一條問題起?相當激烈?爭?。到?今日，大量?科?證據令到?大多數?科學家都接受?「進化論的確能?準確?樣描述到自然現象」?一點，而且除?理論上?價?，進化論? 農業 、醫學、寵物配種甚至乎係 人工智能 等多方面? 應用科學 上都好好用，成??好多科學家做??陣走??要學?知識 ^{[130] [131]} 。

宗?觀點

進化論引起?宗?方面?熱議。??一世紀初，?同?宗?團體對於進化論?意見有相當大分?：

• 基督? ? 羅馬天主?會 ?官方觀點係「任何信徒都有權自由揀係?相信對《 創世紀 》?字面解讀」：天主?徒有得揀相信上帝?係用?六日創造所有?，又有得揀相信進化論同埋 宇宙大爆炸 等?科學理論；天主?會認?，上帝有用到進化?過程?創造人同埋各種生物?肉體，但無論人類係進化出?定係特殊?創造，??都係有特殊?創造? 靈魂 ，所以係特別?；一般?講，? 天主?學校 入面，?老師?進化論??學生知係?問題? ^{[132] [133]} 。而一般?講，? 天主?學校 入面，老師?進化論??學生知係?問題?。
• 新? 內部就有?細?分?：有?比較 原?旨主義 ?新?徒主張 聖經 入面寫?所有?都係 歷史 事實（雖然 地質學 、 宇宙學 同埋 考古學 等多個領域??究都???個觀點，而且聖經有某?描述自相 矛盾 ），而進化論?符合《創世紀》等聖經章節?字面內容，所以係??確? ^[134] ；雖然係?， 美國 ?新?徒組織 美國科學聯系 ^{[e 70]} 就提出? 進化創造 ^{[e 71]} ?觀點，認?上帝?創造宇宙?陣，聰明?設下?一?自然定律，再???自然定律自己運行?且最後創造出 地球 同 生命 ，而進化?機制就係??定律?一部? ^[135] 。而且不論?派，有好多基督徒都認?好似係《創世紀》?? 舊約聖經 入面?內容應該當做 先知 受上帝?發而寫出?? 寓言型 故仔 ，?應該當係歷史??讀，所以對進化論持接受態度 ^[136] 。因???內部分?，?新?徒?? 學校 或者係?新?徒多?地區，老師?進化論有時會?到部?新?徒家長不滿 ^[137] 。
• ?基督?以外，有好多相信上帝存在?人都對進化論持接納?態度：例如係主張 理神論 （ ^{[e 72]} 一種信上帝但反宗??觀點，認?上帝?會直接介入宇宙?事務，所以?會派先知?人世）?人士?，???接受聖經，更加?會相信舊約聖經?內容係歷史，所以普遍都對進化論相當之受落，認?進化有效?展示出上帝點樣「?使直接?手落宇宙?度，都創造到人等?有 智能 生命」 ^[138] 。

「理論」

?人?批評進化論?陣，其中一個最常見?講法係話 進化只不過係一個理論 ^{[e 73]} 。對於?個論調，英國科學家 道金斯 ^{[e 74]} 就?講：

?人有陣時會嘗試?辯論當中用??方法爭分數（指嘗試?一場辯論），話「進化只不過係一個理論」。?個講法正確，不過人有需要理解?句?係??意思。「世界圍住 太陽 轉」都一樣只係一個理論－只係一個有極大量 證據 支??理論。 ^{[e 75]}

?日常英文用語裏面， theory （一般會譯做 理論 ）?個字最廣義上可以係指「對某?現象?講法」 ^[139] ，而根據?個定義，「地球圍住太陽轉」同「舊約聖經係歷史」等??法都一樣係「理論」。?嚴謹?科學上， 科學理論 係指「嘗試對 大自然 某?現象作出，而且有一定證據支?」?解釋；事實上，進化論受到 相當大量?證據 支?，而且?實際應用上?係能???預測現象 ^{[111] [140]} ，所以一般認?，進化論算係一個嚴謹科學定義上?理論，而「舊約聖經係歷史」?一個?法?算 ^[141] 。

種族主義

?一方面，又有?少人批評話進化論提倡 種族主義 。一般認?，?個批評係個 草人謬論 （ ^{[e 76]} 指批評者?度批評緊一個受批評者根本?主張過?立場），例如 加拿大 哲學家 基斯道化·天道 ^{[e 77]} 就用美國 路易斯安那州 議會? 2001 年?過?一個法案?做草人謬論?例子。?個法案?內容大致上係?? ^[142] ：

進化論之父?理斯·達爾文寫??提倡將種族主義合理化，??兩本書《物種起源》 ^{[e 78]} 同《 人類?由來 》 ^{[e 79]} 提出?一個高等種族同低等種族?分級... 因??，一貫反對任何形式?種族主義?路易斯安那州議會??度拒?主張「某?種族?人高等過其他種族?人」?達爾文主義理念??核心理念，?且遣責利用??思想來將種族主義合理化?行徑。 ^{[e 80]}

天道指出，?個法案?度 打緊草人 （ ^{[e 81]} 指「批評對方?主張過?立場」?一個?動）：實際上，達爾文??主張過種族主義 ^{[註 11] [143]} 。達爾文?正講緊??係物競天擇引致物種一代一代?改變－?係指?自然界，同一個生物族群入面?某?個體會比較擅長生存同 繁殖 ，所以比較大機會能?將自己帶?基因傳?後代，引致每一個族群?基因庫都會一代一代?變樣，只係客觀?描述?同族群?身體結構上會有?同，而?係邊個族群「高等」?。對於種族之間?差異，達爾文個理論會講?係「白人同 黑人 等?同種族適應?各自?同?生存環境－ 歐洲 同 非洲 －而進化到身體結構上有??同」，例如非洲太陽猛?，所以黑人進化到皮膚 黑色素 多?保護皮膚 ^{[142] [144]} 。

應用

到??一世紀初，進化論有廣泛?應用價?，例如：

• 動物配種 ，指用遺傳學?知識去安排動物交配，令動物?後代?生預期中?特徵（?係 人工選擇 ），簡單?例子有特登淨係? ?公 同?生得 蛋 多? ?? 交配，嘗試?生出能?生多蛋?下一代??，再進階??動物配種可以用到對配緊?動物?遺傳基因?知識 ^[145] 。
• 植物配種 ，同動物配種一樣，不過用?係 植物 ，例子有 蔬菜 同 生果 品種?配種 ^[146] 。
• 進化心理學 ， 心理學 一個子領域，集中於思考進化點樣影響現代人?行－心理同行??特徵由一隻動物? 神經系統 主宰，而神經系統?結構等特徵可以受基因影響，基因會受進化影響，所以原則上，人類等?現代動物?心理同行?特徵理應一定程度上反映???進化史 ^[147] 。
• 進化醫學 ，指運用進化論上?知識做醫學相關??究，簡單?例子有?究致病細菌?進化，可以?返上面哈佛大學大腸桿菌?究?例子 ^[148] 。
• 進化演算法 係一種建基於 物競天擇 ?念? 機械學習演算法 ，同一般機械學習做法?同?係，進化演算法會用隨機?方法 初始化 ?生出一大?模型，然後揀個表現指標，淘汰走?表現?好?個體，?且??表現?個體「繁殖」（????生同自己相似?模型），令到後代?表現好過前代? ^[9] 。
• 文化進化 將進化論上??頭 廣義化 ，用?解釋 文化 ?演變－文化可以定義?「能?影響人?行?、可以?人之間傳播? 資訊 」 ^[149] ，每一?文化傳播都有可能成功，而成功?機會率視乎??文化資訊?特徵而定，例如好笑? 笑話 比較大機會會令聽?個人開心同埋想將個笑話講?第個人聽，所以成功傳播?機會率會高?；?係話一?文化資訊同一個基因一樣，「表現好就有得被複製（由一個人? 腦 傳去第個人?腦）」，於是有?少 社會學家 就主張，進化論上??念可以應用?分析文化?演變 ^[150] 。可以?埋 模因 ^{[e 82]} 同 語言演變 ??念。

... 等等。

註釋

?埋

文獻

入門書：

進階書：

引?

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篇文引用?以下?? 文獻 同 網頁 ：

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維基同享 有多媒體??：
進化

• （英文） " Evolution "， BBC
• （英文） " Evolution Resources from the National Academies "
• （英文） " Understanding Evolution: your one-stop resource for information on evolution "
• （英文） " Evolution Matters Lecture Series "
• （英文） Stearns, Stephen C. " EEB 122: Principles of Evolution, Ecology and Behavior "， 耶魯大學