Phytophthora

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Phytophthora
Description de cette image, également commentée ci-après
Phytophthora porri sur une feuille de poireau ( Allium porrum )
Classification MycoBank
Regne Chromista
Embranchement Oomycota
Classe Oomycetes
Ordre Peronosporales
Famille Peronosporaceae

Genre

Phytophthora
de Bary , 1876

Synonymes

Phytophthora (du Grec : φυτ?ν (phyton), “plante” and φθορ? (phthora), “destruction”) est un genre de ≪  champignons  ≫ oomycetes phytopathogenes infectant un grand nombre de vegetaux parmi lesquels se trouvent plusieurs plantes ou arbres cultives tels la pomme de terre , la vigne , le chataignier ou le pommier . Il touche egalement les cactus ( mildiou des cactees ). Le genre est decrit pour la premiere fois en 1875 par Heinrich Anton de Bary . Approximativement 100 especes de Phytophthora ont ete decrites, cependant on estime leur nombre entre 100 et 500 [ 2 ] .

Biologie [ modifier | modifier le code ]

Ces organismes autrefois classes parmi les champignons sont aujourd'hui rattaches aux stramenopiles . En effet, bien que presentant un aspect morphologique semblable aux champignons de par la presence de mycelium , leur biologie ( metabolisme , cycle de reproduction sexuee) est tres differente. La confusion taxonomique des oomycetes avec les champignons phytopathogenes a entraine un retard dans l'acquisition de connaissances sur ce phytopathogene majeur.

Les Phytophthora sont des parasites qui ont des modes d'infection de type biotrophe , necrotrophe et hemibiotrophe . Selon l'espece consideree, une souche peut etre pas, peu ou tres pathogene et plus ou moins virulente selon les conditions de l'environnement et l'espece hote infectee. La gamme d' hotes peut etre etroite et limitee a quelques especes ( Phytophthora infestans ) ou bien large et englobant plusieurs genres et familles de vegetaux differents ( Phytophthora ramorum , Phytophthora cinnamomi ) [ 3 ] .

Les Phytophthora sont diploides a l'etat vegetatif et presentent des cycles de reproduction asexuee et sexuee. Le cycle de reproduction asexuee se realise a l'aide de sporanges et de zoospores ainsi que de chlamydospores pour certaines especes. Le cycle de reproduction sexuee fait intervenir la production de gametanges ou se deroule la meiose ( antheridie et oogone ) qui fusionneront pour former une oospore . Ils peuvent croitre et se reproduire in vitro sans plante-hote en milieux liquides ou geloses, synthetiques ou a base d'extraits vegetaux. Cependant, la presence de certains produits comme les sterols sont essentiels pour la fabrication des oospores.

Ecologie [ modifier | modifier le code ]

On sait que ces organismes peuvent etre transportes par les canaux et cours d'eau [ 4 ] .

Phytophthora peut aussi toucher les arbres (semis et racines des hetres matures par exemple), peut etre au cours de co-infections ou d'infections opportunistes (apres des gels, secheresses ou pluies polluees par exemple).

Dans toute l'Europe, une espece de Phytophthora , P. xalni , est responsable de deperissements massifs d' aulnes en bord de rivieres depuis la fin des annees 1990. Cette espece est un hybride sterile qui craint les extremes du climat. Elle est favorisee par le rechauffement du climat dans le NE de la France (hivers moins froids), mais craint les etes caniculaires du SE.

On l'a cru cause premiere des deperissements presque foudroyants de marronniers observes dans les annees 2000, mais il pourrait n'etre qu'un agent secondaire opportuniste, car non systematiquement trouve. Le marronnier serait plutot victime de la bacterie Pseudomonas syringae .

En 2012 , apres des pluies printanieres prolongees, on a constate [ 5 ] en Allemagne du sud, une mortalite importante des pousses basses de l'annee, chez de jeunes hetres (en sous-etage, jusqu’a une hauteur de 2 m) ; les necroses touchant parfois aussi les tissus de l’annee precedente. Une cinquantaine de branches ont ete analysees, et un specimen du genre Phytophthora retrouve dans presque 70 % des cas. Il semblait provenir du sol et remonter vers les parties aeriennes (via les eclaboussures de pluie, ou via des spores remontes par des insectes et/ou escargots) [ 5 ] . Des forestiers craignent que la regeneration naturelle et artificielle du hetre, notamment en sous-etage en soit affectee (par un ralentissement de croissance et affaiblissement des jeunes plants, notamment sur sols tres humides ou peu drainants et deja infeste par Phytophthora ).

Especes de Phytophthora [ modifier | modifier le code ]

C'est un groupe d'especes qui co-evolue probablement depuis tres longtemps avec les plantes, en s'adaptant par de multiples strategies a leurs systemes de defense. Il est possible que les activites humaines (echanges et transports de produits agricoles, sylvicoles et horticoles) aient pu contribuer a propager certaines souches pathogenes dans le monde ( mildiou de la pomme de terre par exemple) ou a les favoriser en degradant les sols et la diversite des vegetaux cultives. Des souches introduites peuvent attaquer des especes indigenes. Par exemple, un colloque [ 6 ] a indique qu'en Australie en 2001 Phytophthora cinnamomi affectait directement 2000 des 9000 especes indigenes du continent.
En 2010, on en connaissait 98 especes [ 7 ] , mais malgre les progres de la systematique moleculaire, des confusions sont encore possibles dans la reconnaissance de nouvelles especes et des difficultes persistent dans l'identification des especes. Ceci est en partie du au fait que certaines sequences de la GenBank sont encore mal identifiees (a partir de cultures parfois mal annotees). Des complexes d'especes de P. capsici, P. citricola, P. cryptogea, P. dreschleri, P. megasperma pourront faire l'objet de revision taxonomie [ 7 ] .

Certains sont consideres comme des pathogenes emergents, faisant l'objet de suivis dans certains pays  :

Traitement [ modifier | modifier le code ]

Un traitement au Trichoderma harzianum peut etre efficace dans certaines conditions [ 8 ] .

En preventif, l'Aliette , un fongicide systemique autorise en France est efficace sur la plupart des plantes, tout en menageant les mycorhizes et la pedofaune .

Liste des taxons de rang inferieur [ modifier | modifier le code ]

Liste des especes selon GBIF (19 avril 2022) [ 1 ]  :

Notes et references [ modifier | modifier le code ]

  1. ↑ a b c d e f g h et i GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulte le 19 avril 2022
  2. ↑ Brasier CM, 2009. Phytophthora biodiversity: how many Phytophthora species are there? In: Goheen EM, Frankel SJ, eds. Phytophthoras in Forests and Natural Ecosystems. Albany, CA, USA: USDA Forest Service: General Technical Report PSW-GTR-221, 101?15.
  3. ↑ Jean-Francois Morot-Gaudry, Roger Prat (dir.), Biologie vegetale. Croissance et developpement , Dunod , , p.  222-223
  4. ↑ Genotypes of Phytophthora ramorum in Waterways in Washington State Gary A Chastagner1, Katie Coats1, Daniel Omdal2, Amy Ramsey-Kroll2, and Marianne Elliott1 ( Resume )
  5. ↑ a et b Nechwatal J., Hahn J., Schonborn A., Schmitz G. [2011]. A twig blight of understorey European beech (Fagus sylvatica) caused by soilborne Phytophtora spp. Forest Pathology 41 : 493-500 (8 p., 2 fig., 2 tab., 38 ref.).
  6. ↑ Second International Meeting on Phytophthora in Forests and Natural Ecosystems , Albany, Western Australia, Sept-Oct 2001.
  7. ↑ a et b Abstracts: 5th IUFRO Phytophthoras in Forests and Natural Ecosystems Auckland and Rotorua, New Zealand, 7-12 March 2010
  8. ↑ Biological control of Phytophthora cambivora (Petri) Buisman in chesnut tree

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