HCoV-HKU1

HCoV-HKU1

Classification

Domaine	Riboviria
Regne	Orthornavirae
Embranchement	Pisuviricota
Classe	Pisoniviricetes
Ordre	Nidovirales
Sous-ordre	Cornidovirineae
Famille	Coronaviridae
Sous-famille	Orthocoronavirinae
Genre	Betacoronavirus
Sous-genre	Embecovirus

Espece

HCoV-HKU1
ICTV ^{[ 1 ]}

Le coronavirus humain HKU1 (nom scientifique Human coronavirus HKU1 , acronyme HCoV-HKU1 ) est une espece de coronavirus provenant de souris infectees. Chez l'humain, l'infection entraine une maladie des voies respiratoires superieures avec des symptomes du rhume , mais peut evoluer vers une pneumonie et une bronchiolite ^{[ 2 ]} . Il a ete decouvert pour la premiere fois en janvier 2005 chez deux patients a Hong Kong ^{[ 3 ]} . Des recherches ulterieures ont revele qu'il avait une distribution mondiale et une genese anterieure.

Il s'agit d'un virus a ARN simple brin enveloppe , de sens positif , qui penetre dans sa cellule hote en se liant au recepteur de l'acide N-acetyl-9-O-acetylneuraminique ^{[ 2 ]} . Il possede le gene de l' hemagglutinine esterase (HE), qui le distingue en tant que membre du genre Betacoronavirus et du sous-genre Embecovirus ^{[ 4 ]} .

Histoire [ modifier | modifier le code ]

HCoV-HKU1 a ete detecte pour la premiere fois en janvier 2005 chez un homme de 71 ans hospitalise en raison de symptomes de detresse respiratoire aigue et d'une pneumonie bilaterale confirmee par radiographie. L'homme etait recemment revenu a Hong Kong de Shenzhen, en Chine ^{[ 3 ] , [ 5 ]} .

HCoV-HKU1 est l'un des six coronavirus humains qui incluent HCoV-229E , HCoV-NL63 , Betacoronavirus 1 ( HCoV-OC43 ), MERS-CoV et SARSr-CoV ( SARS-CoV-1 et SARS-CoV-2 ). Le genome de ce coronavirus presente une identite de sequence de 52 % avec le SARS-CoV-2 ^{[ 6 ]} .

L'analyse phylogenetique montre que HCoV-HKU1 appartient au groupe 2 des coronavirus (a present reconnu comme le genre Betacoronavirus ) et qu'il est assez proche du coronavirus murin dont differentes souches infectent rats et souris ( rat CoV Parker , virus de l'hepatite murine) et distinct des autres coronavirus humains dont HCoV-OC43 ^{[ 5 ]} . On considere que ce coronavirus humain derive du coronavirus murin sans qu'un hote intermediaire n'ait ete identifie ^{[ 7 ]} .

Epidemiologie [ modifier | modifier le code ]

Une analyse retrospective des aspirations nasopharyngees negatives au SRAS de patients atteints de maladie respiratoire au cours de la periode du SRAS en 2003, a identifie la presence d'ARN de HCoV-HKU1 dans l'echantillon d'une femme de 35 ans atteinte de pneumonie ^{[ 3 ]} .

A la suite des premiers rapports de decouverte du HCoV-HKU1, le virus a ete identifie la meme annee chez 10 patients dans le nord de l' Australie . Des echantillons respiratoires ont ete preleves entre mai et aout (hiver austral). La plupart des echantillons positifs pour le HCoV-HKU1 provenaient d'enfants au cours des derniers mois d'hiver ^{[ 8 ]} .

Les premiers cas connus dans l'hemisphere occidental ont ete decouverts en 2005 apres avoir analyse des echantillons plus anciens par des virologues cliniques a l' hopital de Yale-New Haven   (en) a New Haven (Connecticut), qui etaient curieux de decouvrir si le HCoV-HKU1 etait dans leur region. Ils ont mene une etude sur des specimens preleves sur une periode de 7 semaines (decembre 2001 - fevrier 2002) chez 851 nourrissons et enfants. Les echantillons de neuf enfants se sont reveles positifs pour HCoV-HKU1; ces enfants avaient des infections des voies respiratoires au moment ou les echantillons ont ete preleves (chez une fille, si severe qu'une ventilation mecanique etait necessaire), tout en testant negatifs pour d'autres causes comme le virus respiratoire syncytial humain, les virus parainfluenza (types 1 a 3), les virus de la grippe A et B, et les adenovirus par dosage par immunofluorescence directe , ainsi que metapneumovirus humain et HCoV-NL63 par reaction en chaine par polymerase apres transcription inverse (RT-PCR). La similitude des souches identifiees a New Haven avec souche initialement trouvee a Hong Kong a suggere une distribution mondiale de HCoV-HKU1 ^{[ 9 ]} .

En juillet 2005, six cas ont ete signales en France en utilisant des techniques ameliorees pour recuperer le virus des aspirations nasopharyngees et des echantillons de selles ^{[ 10 ]} .

References [ modifier | modifier le code ]

• Portail de la medecine
• Portail de la virologie