En
classifications
biologiques
, le
domaine
(
neolatinise
en
dominium
) est le premier niveau de rang, au-dessus des
regnes
.
Le terme
domaine
a ete introduit pour discuter de la classification du
monde vivant
selon un modele divisant celui-ci en trois grands groupes supposes
monophyletiques
[
1
]
. Bien que pratique, le modele a trois domaines est critiquable puisqu'au moins l'un d'entre eux n'est pas monophyletique. Par ailleurs, certains taxonomistes lui preferent, au nom de l'anteriorite, le terme vieilli d'
empire
.
La classification de
Carl Woese
et al.
(1977, 1990)
[
2
]
,
[
3
]
,
[
4
]
distingue trois domaines presumes
monophyletiques
:
- le domaine
Bacteria
(ou
Eubacteria
) ;
- le domaine
Archaea
(ou
Archaebacteria
) ;
- et le domaine
Eukaryota
(ou
Eucarya
).
Ces
taxons
, s'ils possedent un heritage genetique commun (les genes impliques dans le
metabolisme
general des cellules eucaryotes sont d’origine bacterienne, tandis que ceux lies aux processus de
replication
et de
reparation de l'ADN
ainsi que de la
traduction genetique
sont d'origine archeenne), comportent en effet des differences fondamentales dans leurs genomes ou leur morphologie
[
5
]
.
Les
unicontes
et
bicontes
sont des
sous-domaines
des Eucaryotes
[
6
]
.
D'autres modeles ont ete proposes, parmi lesquels :
Le modele a trois domaines permet une vision synthetique dans une optique
evolutionniste
mais ne correspond pas exactement a la
phylogenie
du vivant.
Pour les
systematiciens phylogenetiques
, le modele a trois domaines est mis en defaut s'il se confirme que les
eucaryotes
emergent parmi les
archees d'Asgard
[
13
]
. Les archees dans leur ensemble ne constituent donc pas le
groupe frere
des eucaryotes et les archees seuls (sans les eucaryotes) constituent un groupe
paraphyletique
, les
Neomura
selon
Thomas Cavalier-Smith
. Or, la
classification phylogenetique
ne reconnait que des
clades
(
monophyletiques
)
[
14
]
. La decouverte des archees d'Asgard en 2015 renforce ainsi les etudes phylogenetiques suggerant qu'il y a seulement deux domaines, les bacteries et les archees qui forment les deux grandes lignees ancestrales independantes.
Pour les
systematiciens evolutionnistes
, la classification du monde vivant ne devrait pas se fonder uniquement sur des
clades
mais devrait incorporer le concept de
grade evolutif
[
15
]
(voir aussi
empire
et
plan d'organisation
). De ce point de vue, les archees,
procaryotes
, se distinguent nettement des
eucaryotes
, lesquels ont beaucoup evolue avec notamment l'acquisition d'un
noyau
et, par
endosymbiose
avec une
α-proteobacterie
, d'une
mitochondrie
.
Les
rangs taxonomiques
[
a
]
utilises en
systematique
pour la
classification
hierarchique du monde vivant sont les suivants (par ordre decroissant) :
- ↑
En gras les sept rangs principaux (RECOFGE, sigle mnemotechnique pour Regne/Embranchement/Classe/Ordre/Famille/Genre/Espece), en maigre les rangs secondaires. En
romain
les noms vulgaires, en
italique
les
noms scientifiques
.
- ↑
Un embranchement en zoologie, ou division en botanique, est traditionnellement caracterise par une description schematique appelee ≪
plan d'organisation
≫.
- ↑
a
b
et
c
Les taxons aux rangs de
race
et de
sous-race
(animaux domestiques principalement) n'ont pas de
nom scientifique
. Ils ne sont pas regis par le
Code international de nomenclature zoologique
(CINZ).
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