Coronavirus

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Orthocoronavirinae  · Orthocoronavirines, Orthocoronavirus

Page d’aide sur l’homonymie

Cet article concerne la sous-famille infectant les oiseaux et les mammiferes (dont les humains). Pour l'ensemble des coronavirus, voir Coronaviridae . Pour le coronavirus responsable de la Covid-19 , voir SARS-CoV-2 .

Orthocoronavirinae
Description de cette image, également commentée ci-après
Virions de SARS-CoV .
Classification ICTV
Realm Riboviria
Regne Orthornavirae
Embranchement Pisuviricota
Classe Pisoniviricetes
Ordre Nidovirales
Sous-ordre Cornidovirineae
Famille Coronaviridae

Sous-famille

Orthocoronavirinae
ICTV 2018 [ 1 ]

Genres de rang inferieur

SARS-CoV-2 3D virion

Les orthocoronavirus ( CoV ) sont des virus qui constituent la sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae (les coronavirus ). Le nom ≪ coronavirus ≫, du latin signifiant ≪ virus a couronne ≫, est du a l'apparence des virions sous un microscope electronique , avec une frange de grandes projections bulbeuses qui evoquent une couronne solaire [ 2 ] .

Ces coronavirus sont munis d'une enveloppe virale incluant une capside caracterisee par des proteines en forme de massue (appelees spicules ). Ils ont un genome a ARN monocatenaire (c'est-a-dire a un seul brin), de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore ), de 26 a 32 kilobases (ce qui en fait les plus grands genomes parmi les virus a ARN ) [ 3 ] . Ils se classent parmi les Nidovirales , ordre de virus produisant un jeu imbrique d' ARNm sous-genomiques lors de l'infection. Des spicules , une enveloppe , membrane et capside contribuent a la structure d'ensemble de tous les coronavirus. Ils peuvent muter et se recombiner [ 4 ] .

Les chauves-souris et les oiseaux , en tant que vertebres volants a sang chaud , seraient les hotes ideaux pour les coronavirus assurant l'evolution et la dissemination du virus [ 5 ] . Ces coronavirus sont normalement specifiques a un taxon animal comme hote, mammiferes ou oiseaux selon leur espece ; mais ils peuvent parfois changer d'hote a la suite d'une mutation . Leur transmission interhumaine se produit principalement par contacts etroits via des aerosols respiratoires generees par les eternuements, la toux ou la phonation. Plus de 500 types de coronavirus ont ete isolees chez la chauve-souris et il existerait plus de 5 000 types de coronavirus [ 6 ] .

Sept principaux coronavirus sont generalement cites comme pouvant contaminer l' humain [ 7 ] . Un huitieme a ete identifie : le B814 [ 8 ] (le premier coronavirus humain identifie), mais cette souche semble ne plus circuler.

Quatre coronavirus en circulation sont consideres comme sources d'infection benignes : 229E , NL63 , OC43 et HKU1 . Ils seraient la cause de 15 a 30 % des rhumes courants.

Plus recemment ont ete identifies trois types de coronavirus responsables de graves pneumopathies  :

Decouverte, histoire [ modifier | modifier le code ]

Illustration de la morphologie des coronavirus. Les peplomeres , pointes virales en forme de massue ici colorees en rouge, creent l'apparence d'une couronne entourant le virion , lorsqu'ils sont vus au microscope electronique .

Les coronavirus existent probablement depuis au moins des centaines de millions d'annees, mais du point de vue de l'epidemiologie et de l'histoire medicale et en tant que zoonose c'est au XXI e  siecle qu'ils ont pris de l'importance : ≪ cinq des sept coronavirus humains ont ete isoles au cours de ce siecle. Et malheureusement, les trois derniers sont entres dans notre vie avec les craintes liees a une epidemie, une pandemie ou a la mort ≫ [ 9 ] .

C'est en 1930 aux Etats-Unis que la premiere maladie due a un coronavirus est observee, chez des volailles . L'annee suivante, un medecin decrit dans un article la maladie qui cause une detresse respiratoire chez la poule et une diminution de la ponte et de la qualite des œufs. En 1937 , l'agent infectieux, le virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV pour Infectious Bronchitis Virus ) est isole. [ref. necessaire]

En 1946 , un autre coronavirus est identifie, le Coronavirus de la gastro-enterite transmissible porcine (TGEV). Independamment, en 1949 a New York et 1951 a Londres , deux equipes decouvrent le virus de l'hepatite murine chez une souris paralysee [ 10 ] .

En 1965 , le premier coronavirus infectant l'etre humain (la souche B814 ) est decouvert. Et rapidement, d'autres suivent : 229E en 1966 et OC43 en 1967 [ 11 ] , qui sont la cause de rhumes plus ou moins graves selon les personnes. L'annee suivante, ils sont observes au microscope electronique par June Almeida et David Tyrrell qui mettent en evidence leur structure en couronne [ 12 ] . La relation est faite entre tous ces virus, et le terme de ≪ coronavirus ≫ est pour la premiere fois utilise dans la revue Nature en 1968 [ 2 ] , [ 10 ] .

Avec la decouverte en 2018 de coronavirus infectant des amphibiens et classes dans une sous-famille a part ( letovirus ), les coronavirus infectant des amniotes (comme ses mammiferes et des oiseaux ) sont classees dans la sous-famille Orthocoronavirinae [ 1 ] et qualifies plus precisement d'orthocoronavirus [ 13 ] .

Epidemie du XXI e  siecle [ modifier | modifier le code ]

Pandemie de Coronavirus [ modifier | modifier le code ]

Le dernier coronavirus humain (ou recemment humanise, tres probablement a partir d'une ou plusieurs souches portees par des chauves-souris) semble avoir emerge a Wuhan en Chine en 2019 : le SARS-CoV-2 . La maladie qu'il cause ( Covid-19 ) a provoque en quelques mois la premiere grande pandemie a coronavirus, caracterisee par un R 0 eleve (2,3 en moyenne d'apres les estimations disponibles en , mais qui semble pouvoir atteindre 5,7) ; avec un taux de letalite de 6,3 (tres variable selon les ages et les contextes, pouvant parfois depasser 15%) [ 9 ] .

Pandemie de Coronavirus
Pandemie Date Cas confirmes Deces Guerisons Sous-type implique
Epidemie de SRAS de 2002-2004 2002-2004 8 096 774 - Sars-Cov (SRAS)
Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient 2012-2014 361 107 - MERS-CoV
Pandemie de Covid-19 (En cours) 2019-2024 + 250 847 494 ( ) [ 14 ] + 5 064 350 ( ) [ 14 ] + 220 905 435 ( ) [ 14 ] SARS-CoV-2 ( Covid-19 )

Caracterisation [ modifier | modifier le code ]

La taxonomie de ces nouveaux virus fait d'abord debat, pour finalement aboutir en 1975 a la creation d'une nouvelle famille ( Coronaviridae ) et d'une nouvelle sous-famille ( Orthocoronavirinae ) par l' International Committee on Taxonomy of Viruses [ 10 ] .

Denomination [ modifier | modifier le code ]

Le terme coronavirus (du latin corona et virus , litteralement ≪ virus a couronne ≫ [ 15 ] ) provient de l'apparence des virions au microscope electronique , caracterisee par une frange de grandes protuberances entourant l'enveloppe avec l'apparence d'une couronne , par analogie avec la couronne solaire [ 2 ] .

Hotes du virus [ modifier | modifier le code ]

Les hotes ideaux des coronavirus, en tant que vertebres volants a sang chaud , sont les chauves-souris (pour les Alphacoronavirus et les Betacoronavirus ) et les oiseaux (pour les Gammacoronavirus et les Deltacoronavirus ) . Ces especes-reservoir assurent l'evolution et la dissemination des coronavirus [ 5 ] . Chez d'autres especes , les symptomes varient (maladies des voies respiratoires superieures chez la poule , diarrhee chez la vache ou le porc , des voies digestives chez le chat et le chien , etc.). Parfois, aucun symptome n'est associe a leur presence ( ex. : coronavirus du beluga ).

L'etre humain abrite naturellement quatre types de coronavirus benins, qui provoquent des infections des voies respiratoires , comme le rhume , et plus rarement affectent les systemes gastro-intestinaux , cardiaques et nerveux [ 16 ] .

Les groupes de coronavirus ont normalement un hote animal specifique ( mammiferes ou oiseaux [ 17 ] ) mais ils peuvent parfois changer d'hote a la suite d'une mutation . Ce sont de telles mutations qui ont probablement conduit a l'apparition de souches causant de graves infections chez l'homme ( SRAS , MERS et Covid-19 ).

Tropisme [ modifier | modifier le code ]

On a longtemps pense que les coronavirus avaient un tropisme uniquement respiratoire ou gastrointestinal (traduit par des pneumonies et enterocolites dans les cas graves), mais un nombre croissant d'etudes montrent un tropisme bien plus large, cardiovasculaire notamment, et neurologique egalement (des les annees 1980, on a montre que plusieurs coronavirus, dont en dernier cas le SARS-CoV-2 sont clairement aussi neuroinvasifs et neurotropes [ 18 ] , [ 19 ] , [ 20 ] , au point que cette diversite de tropismes et de symptomes font des coronavirus (murins notamment, regroupees sous le sigle de MHV) un modele animal pour l'etude de maladies humaines aussi variees que la sclerose en plaques , l’ hepatite virale ou la pneumonie (S. R. Weiss et al. 2011). Le MHV penetre le Systeme nerveux central (SNC) via les neurones du nerf olfactif , et peut causer une encephalite aigue ou une maladie demyelinisante chronique s'il y persiste (il peut aussi se propager jusqu’a la moelle epiniere ) [ 19 ] , [ 21 ] .

Recherches [ modifier | modifier le code ]

En 2002, l’apparition du Sars-CoV, un virus responsable d'une maladie infectieuse des poumons, pousse l’Union europeenne a lancer plusieurs programmes afin de ne pas etre prise au depourvu en cas de nouvelles emergences. Des 2004, l’equipe de Bruno Canard, directeur de recherche CNRS a Aix-Marseille, specialiste des coronavirus, grace aux reseaux collaboratifs europeens, affiche des resultats prometteurs. ≪?Nous avions eu cette idee qui s’est revelee fructueuse?: les virus ont une capacite enorme a etre differents, varies, avec de larges familles. Nous les avons donc etudies tous en meme temps, afin d’en avoir un modele type qui nous permettrait, en cas de menace d’un virus inconnu, d’en trouver un proche, d’ou nous pourrions extraire des donnees scientifiques [ 22 ] . ≫

Mais des 2006, l’interet des politiques pour le Sars-CoV disparait. La crise financiere de 2008 accelere le desengagement de l’Europe et de la France pour la recherche, les strategies de recherche fondamentale perdent leurs financements. Aussi, en 2015, Bruno Canard denonce le desengagement europeen et francais dans le secteur des sciences et adresse avec ses collegues belges et hollandais, des lettres d’intention a la Commission europeenne expliquant qu’il existe neuf familles de virus pour lesquelles une emergence est possible. ≪?Le premier sur la liste etait le flavivirus , explique-t-il. Le second, le coronavirus. Un an plus tard, apparaissait Zika, un flavivirus ≫. Or, la Commission europeenne ne donnera jamais de reponse. Et en 2020 surgit le Sars-CoV-2, un coronavirus [ 22 ] engendrant la Covid-19 .

Biologie [ modifier | modifier le code ]

Morphologie [ modifier | modifier le code ]

Morphologie d'un coronavirus.

Ce virus enveloppe est constitue d'une enveloppe virale entourant une capside helicoidale qui contient le brin d'ARN. La taille du genome de ces virus varie d'environ 26 a 32  kilobases , valeurs parmi les plus elevees chez les virus a ARN .

Les coronavirus ont en commun des proteines designees par une lettre indiquant leur localisation : S (protuberances), E (enveloppe), M (membrane) et N (nucleocapside). Certains, notamment ceux du sous-groupe A du genre Betacoronavirus , ont une proteine HE ( hemagglutinine esterase   (en) ) caracteristique. Le coronavirus du SRAS presente en outre sur la proteine S un site de liaison specifique a l' enzyme de conversion de l'angiotensine 2 [ 23 ] qui lui sert de point d'entree dans la cellule hote .

La taille physique du virion est classiquement donnee comme etant de 120 a 160  nm [ 24 ] ou comme etant de l'ordre de 125  nm [ 25 ] . Toutefois le SARS-CoV-2 , responsable de la Covid-19 a ete annonce plus recemment comme mesurant approximativement de 60 a 140  nm , et comme etant de forme elliptique avec de nombreuses variations [ 26 ] .

Genome [ modifier | modifier le code ]

Genome et proteines du SRAS-CoV

Tous les CoV ont un genome d'ARN non-segmentes (simple brin) organise de la meme maniere : les deux tiers environ du genome contiennent deux grands ≪  cadres de lecture ouverts  ≫ et se chevauchant (dits ORF1a et ORF1b ). Ces deux cadres sont traduits en ≪  polyproteines replicase ≫ pp1a et pp1ab . ≪ Ces polyproteines sont ensuite traitees pour generer 16 proteines non structurales, designees nsp1 ~ 16. La partie restante du genome contient des ORF pour les proteines structurales, y compris la pointe (S), l'enveloppe (E), la membrane (M) et la nucleoproteine (N). Un certain nombre de proteines accessoires specifiques a la lignee sont egalement codees par differentes lignees de CoV ≫ [ 3 ] , [ 27 ] , [ 28 ] , [ 29 ] .

Replication [ modifier | modifier le code ]

Replication du virus a couronne.

Elle se fait en six etapes successives (voir illustration) :

  1. Grace a leur proteine S , les coronavirus se lient aux molecules cellulaires de surface telles que les metalloproteinases . Les virus dotes en plus de la proteine HE (hemagglutinine-esterase) dans leur enveloppe peuvent aussi se lier a l'acide N-acetylneuraminique qui sert de corecepteur (lui-meme initiateur de l'entree d'un pathogene dans une cellule hote). On ne sait pas clairement si les virus entrent dans la cellule hote par fusion des membranes virales et cellulaires, ou par une internalisation a recepteur . Quel qu’en soit le mecanisme, le brin d'ARN est insere dans la cellule, et la capside (la coque) est abandonnee ;
  2. Les coronavirus sont munis d'un seul genome ARN a brin positif, a present sur place dans le cytoplasme . Le genome de l'ARN du coronavirus a une coiffe methylee 5' et une queue polyadenylee 3', ce qui permet a l'ARN de se fixer aux ribosomes pour la traduction. Les ribosomes de la cellule decodent l'ARN viral, produisant les proteines qui y sont codees ;
  3. D'abord l'ARN positif du virus est transcrit en proteine pour former une ARN polymerase propre (une ARN polymerase ARN-dependante ). La replicase est la premiere proteine fabriquee ; une fois le gene codant la replicase traduit par le ribosome de la cellule hote, la traduction est arretee par un codon stop. Cette replicase virale ne reconnait et produit que l'ARN viral, et permet au genome viral d'etre transcrit en nouvelles copies d'ARN, a l'aide de la machinerie de la cellule hote. Se servant du brin positif comme modele, cet enzyme assemble le brin negatif ;
  4. Par la suite, ce brin negatif sert lui-meme de modele pour transcrire de petits ARN sous-genomiques, qui sont utilises pour fabriquer toutes les autres proteines. C'est ce qu'on appelle une transcription imbriquee. Ce processus est une forme d'economie genetique, permettant au virus de coder le plus grand nombre de genes dans un petit nombre de nucleotides ;
    le genome du brin negatif est traduit par le ribosome de la cellule hote, et une longue polyproteine est formee, ou toutes les proteines virales sont attachees. Les coronavirus ont une proteine non structurale ? une protease ? qui est capable de cliver la polyproteine.
    Par ailleurs, ce brin negatif joue un role dans la replication de nouveaux genomes ARN a brin positif.
    Le cytoplasme de la cellule hote se remplit de proteines et d'ARN viraux ;
  5. (a) La proteine N aide a lier l'ARN genomique pour realiser l’encapsidation du genome virale dans une enveloppe protectrice nommee capside [ 30 ]  ; la proteine M s'integre a la membrane du reticulum endoplasmique , cote capside ; et des proteines HE et S traversent la membrane du reticulum endoplasmique, via la proteine de translocation, et se positionnent du cote oppose ;
    (b) avec la liaison entre la capside et les proteines M, la membrane du reticulum s'invagine, et bourgeonne. La capside (la coque) assemblee dotee d'ARN helicoidal se retrouve alors a l'interieur du reticulum endoplasmique, ayant capture a son profit la membrane de ce dernier, qui porte a present a son exterieur les proteines HE et S ;
  6. Cette progeniture virale est ensuite (a) encapsulee et transportee par des vesicules golgiennes vers la membrane cellulaire, (b) pour etre enfin externalisee (par exocytose ) hors de la cellule.

Taxonomie [ modifier | modifier le code ]

Nommage des coronavirus [ modifier | modifier le code ]

Les coronavirus sont nommes par un groupe d'etude [ 31 ] travaillant au sein de l'ICTV ( International committee on Taxonomy of viruses ) [ 32 ] .

Classification [ modifier | modifier le code ]

Article detaille : Coronaviridae .

Les coronavirus ( CoV ) sont des virus a ARN monocatenaire de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore ) correspondant a la sous-famille Orthocoronavirinae de la taxonomie de l' ICTV [ 33 ] , dans la famille Coronaviridae , et de l'ordre Nidovirales [ 34 ] , [ 35 ] .

Selon les caracteristiques de leurs sequences proteiques, les CoV sont classes en 4 genres (alpha-CoV, beta-CoV, gamma-CoV et delta-CoV), qui tous contiennent des virus pathogenes pour les mammiferes [ 4 ]  :

Arbre phylogenetique des coronavirus
  1. Alphacoronavirus , qui inclut le virus de la diarrhee epidemique porcine (PEDv), le virus de la gastro-enterite transmissible porcine (TGEV), le coronavirus du syndrome de la diarrhee aigue porcine (SADS-CoV), le coronavirus canin , le coronavirus enterique felin , le virus de la peritonite infectieuse feline (FIPV) ;
  2. Betacoronavirus , dont le virus respiratoire du SRAS ( SARS-CoV ), le SARS-CoV-2 , le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient ( MERS-CoV ), virus de l'hepatite murine ( MHV ), coronavirus bovins, virus de la sialodacryoadenite du rat, virus de la sialodacryoadenite porcine, hemagglutinose porcine, virus de l'hemagglutinose porcine coronavirus equin. Dans ce genre Betacoronavirus, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2 appartiennent tous les deux au sous-genre Sarbecovirus au sein duquel trois clades distincts ont ete identifies :
    - Clade1 : souches "chauve-souris" de Bulgarie et Kenya [ 36 ] ,
    - Clade2 : SARS-CoV-2 et souches "chauve-souris" de Chine orientale [ 36 ] ,
    - Clade3 : SARS-CoV et souches "chauves-souris" de Chine du sud-ouest [ 36 ]  ;
  3. Gammacoronavirus : surtout trouve chez des oiseaux migrateurs, causant notamment des bronchites ; un Gammacoronavirus a ete isole d'un beluga en captivite ;
  4. Deltacoronavirus : connus depuis peu, qui semblent surtout infecter les oiseaux, mais aussi trouve chez les porcs.

Remarques  :

  • on a parfois nomme un coronavirus selon l'espece animale ou il a d'abord ete trouve (par exemple : coronavirus respiratoire canin, ou CRCoV pour Canine respiratory coronavirus , virus appartenant au genre betacoronavirus et a son sous-groupe 2a) [ 37 ] , [ 38 ]  ;
  • le dernier coronavirus trouve, en 2019 , est le SARS-CoV-2 , responsable de la pandemie de Covid-19 .
Articles detailles : SARS-CoV-2 , pandemie de Covid-19 et Covid-19 .

Liste des especes [ modifier | modifier le code ]

La sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae est organisee en 4 genres, 22 sous-genres et une quarantaine d'especes [ 39 ]  :

Infection a coronavirus [ modifier | modifier le code ]

Types d'infection [ modifier | modifier le code ]

Sept types de coronavirus infectent couramment l'homme [ 40 ] , dont trois causent des infections graves.

Infections benignes [ modifier | modifier le code ]

Les quatre premiers types connus sont sans gravite : les coronavirus humains 229E , NL63 , OC43 et HKU1 , inconnus chez la chauve-souris. Ils causent des rhumes avec fievre et des maux de gorge dus a des vegetations adenoides gonflees, principalement en hiver et au debut du printemps [ 41 ] .

Les coronavirus seraient la cause de 15 a 30 % des rhumes courants [ 42 ] .

Infections graves [ modifier | modifier le code ]

Transmission et cycle de vie du SRAS-CoV-2 causant COVID-19.

Trois types de coronavirus qui ne se trouvent pas naturellement chez l'homme mais chez des mammiferes ont ete decouverts plus recemment et ont ete a l'origine d'infections graves des poumons ( pneumopathie virale) :

Selon le virus en cause, les formes graves de la maladie ont leurs particularites. Par exemple, la diarrhee etait tres frequente dans le SRAS mais rare dans la maladie a coronavirus 2019 .

Comparaison des infections graves [ modifier | modifier le code ]

Trois principales sources sont utilisees : l' Institut Pasteur , l' OMS et les CDC americains [ 46 ] .

Syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) [ 47 ] , [ 48 ] Syndrome respiratoire aigu severe (SRAS) [ 49 ] , [ 50 ] , [ 51 ] Maladie a coronavirus 2019 (COVID-19)
Agent pathogene MERS-CoV SARS-CoV SARS-CoV-2
Annee d'apparition 2012 2003 2019
Nombre de cas 1 219 8 098 dont 5 327 en Chine. En cours, voir ici
Pourcentage de cas par transmission nosocomiale 70 % [ 52 ] 58 % [ 52 ]
Nombre de deces 449 774 (dont 349 en Chine) En cours, voir ici
Reservoir Dromadaire Chauve-souris Chauve-souris (probablement)
Transmission a l'homme par l'animal Contact direct avec un animal infecte, consommation de lait cru de dromadaire . Consommation de viande de civette palmiste masquee , animal sauvage vendu sur les marches et consomme dans le Sud de la Chine. Un pangolin [ 43 ] pourrait etre l'hote intermediaire.
Transmission interhumaine Oui Oui Oui
Transmission par objet ? Oui Risque tres faible.
Transmission materno-fœtale ? Aucun cas retrouve chez les femmes enceintes infectees par ce virus [ 53 ] . Aucune preuve [ 54 ] .
Transmission par le lait maternel Un seul cas documente [ 55 ] RT-PCR negative sur 16 femmes testees [ 56 ]
Incubation Entre 5 et 15 jours. Entre 2 et 7 jours. Duree mediane d'incubation a 5,1 jours (5,5 jours en moyenne), 97,5 % des personnes seront malades 11,5 jours apres le contact infectieux [ 57 ] .
Porteur sain ? Probablement pas. Oui (un seul cas publie)
Contagiosite Taux de reproduction inferieur a 1 [ 58 ] . Taux de reproduction superieur a 2 [ 58 ] . Mediane du taux de reproduction de base (R 0 ) a 2,79 [ 59 ] .
Duree de la contagiosite ? ? Semble limitee a la periode des signes cliniques. Possibilite disputee de contagion en phase asymptomatique [ 60 ] .
Debut de la periode de contagiosite ? 3 a 4 jours apres le debut des signes cliniques. Des l'apparition des signes cliniques. Porteur asymptomatique prouve [ 61 ] .
Fievre A 98% A 99% A 87.9%, mais peut apparaitre plusieurs jours apres la toux ou les difficultes a respirer.
Diarrhee A 26% A 20% [ 53 ] . A 3.7%.
Transmission par les selles Tres probable mais a joue un role mineur [ 53 ] . Cette possibilite est envisagee [ 62 ] .
Letalite 34,4 % [ 52 ] 9,5 % [ 52 ] , au-dela de 50 % chez les plus de 65 ans. 3,4 % [ 63 ]
Traitement Symptomatique Symptomatique Symptomatique
Vaccin Aucun Aucun En cours
Statut Resurgence possible. Considere comme eradique. Epidemie en cours.

Passage de la barriere des especes [ modifier | modifier le code ]

Origines des coronavirus humains avec d'eventuels hotes intermediaires.

Au vu des sequences genomiques disponibles, deux grands taxons animaux seraient le reservoir principal des CoVs :

Au vu des connaissances disponibles, les coronavirus semblaient avoir besoin d'hotes intermediaires (toujours des mammiferes) pour s'≪ humaniser ≫, c'est-a-dire muter pour pouvoir infecter l'Homme.
Des hotes intermediaires connus ont ete :

Transmission interhumaine [ modifier | modifier le code ]

Articles detailles : Maladie a coronavirus 2019 et SARS-CoV-2 .
Particules ejectees par un eternuement.

La transmission interhumaine des coronavirus se fait principalement par les gouttelettes ou des aerosols respiratoires expectorees par une personne infectee (via la toux, les eternuements, des postillons, ou parfois par le simple fait de parler fort ou en criant ) quand les particules virales sont inhalees par une personne se trouve a proximite. La transmission et la contagiosite varient aussi selon le coronavirus, et peut-etre selon sa souche au sein d'une epidemie.

Article detaille : Contagion#Donnees recentes sur la contagion par les bioaerosols .

La prophylaxie passe par une prevention primaire visant a limiter la transmission du virus : eviter les contacts (surfaces potentiellement contaminees, poignees de main, embrassades), se laver les mains frequemment, eviter de se toucher les yeux, le nez ou la bouche, par ou le virus peut s'introduire dans l'organisme. En cas de symptomes de type toux ou rhume, se maintenir a au moins 1 metre de toute personne et eviter d'emettre des particules contaminees [ 65 ] .

D'autres recommandations comprennent [ 66 ]  :

  • ne pas entrer en contact avec des animaux manifestement malades, ne pas consommer de viandes provenant d'animaux malades ;
  • ne pas consommer de produits animaux (viande...) mal cuits, ni de legumes crus s'ils n'ont pas ete laves avec de l'eau non contaminee.

Traitement [ modifier | modifier le code ]

Dans le cas du SRAS, des medicaments ont ete utilises pour tenter d'enrayer l'epidemie : la ribavirine , un analogue de nucleotides, des anti-inflammatoires steroidiens et, apres identification formelle de l' agent pathogene et des criblages de sensibilite, l' interferon-alpha et des inhibiteurs de proteases . Leur efficacite est encore sujette a caution. Aucun n'a fait l'objet d'une etude clinique adequate : beaucoup d'etudes disponibles ne permettent pas de conclusions scientifiques claires car elles ont ete realisees sur de petits nombres de sujets ou alors sans protocole ou dose fixe. Certaines indiquent meme que ces traitements pourraient avoir nui a l'eradication du virus [ 67 ] .

Bruno Canard denonce en l'emballement et publie une lettre ouverte Coronavirus : la science ne marche pas dans l’urgence ! [ 68 ] . Il declare : ≪?Un vaccin demande au mieux 18 mois de recherches. Et pour des virus non previsibles, qui changent, il n’est pas adapte. Mieux vaut faire des medicaments qui ont un large spectre dans une famille virale. Cela peut necessiter 5 ans, parfois 10. D’ou l’importance de l’anticipation scientifique [ 22 ] .?≫

Article detaille : Developpement et recherche de medicaments contre la Covid-19 .

Vaccins [ modifier | modifier le code ]

Des vaccins a base de virus inactive et d'autres fondes sur les proteines S et N sont a l'etude depuis plusieurs annees [ 69 ] quand l'eradication rapide de l'epidemie de SRAS vient interrompre les essais cliniques. Cependant, les elements viraux produisant l'immunite ne sont souvent pas assez conserves dans la meme famille virale : ≪ s'il y avait eu un vaccin contre le coronavirus de 2003, il est pratiquement certain qu'il n'aurait pas marche de maniere satisfaisante contre [la] Covid-19 ≫ (Bruno Canard) [ 70 ] .

Bien que n'ayant pas abouti a leur certification, la recherche de vaccins contre le SRAS a rendu possible l'obtention rapide de vaccins contre la Covid-19 . Ainsi, le vaccin de Pfizer et BioNTech est concu en quelques heures des [ 71 ] , et autorise au Royaume-Uni en decembre. En , 60 vaccins contre le SARS-CoV-2 sont autorises ou en phase d'etude clinique, et 172 vaccins potentiels sont a l'etude [ 72 ] .

En 2023, certains variants du SARS-CoV-2 , et notamment le variant Omicron , echappent en partie aux differents vaccins administres. Plusieurs equipes dans le monde cherchent a produire des vaccins conferant une immunite plus durable et plus efficace contre les variants existants et a venir, ainsi que contre d'autres coronavirus. Elles utilisent de nouvelles approches [ 73 ]  : elargissement des cibles proteiniques et recherche de nouvelles cibles, emploi de nanoparticules ,  etc.

Dans la culture populaire [ modifier | modifier le code ]

Un Romain dans la bande dessinee Asterix se nomme Coronavirus.

Notes et references [ modifier | modifier le code ]

  1. ↑ a et b ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulte le 1era out 2023
  2. ↑ a b et c (en) ≪  Virology: Coronaviruses  ≫, Nature , vol.  220, n o  5168,‎ , p.  650?650 ( ISSN   0028-0836 et 1476-4687 , PMCID   PMC7086490 , DOI   10.1038/220650b0 , lire en ligne , consulte le )
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Voir aussi [ modifier | modifier le code ]

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Infographie [ modifier | modifier le code ]

Articles connexes [ modifier | modifier le code ]

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