Ciliophora

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Ciliophora
Description de cette image, également commentée ci-après
Des Cilies dessines par Ernst Haeckel (1904).
Classification WoRMS
Regne Chromista
Sous-regne Harosa
Infra-regne Alveolata

Embranchement

Ciliophora
Doflein   (d) , 1901

Synonymes

  • Ciliata Perty, 1852
  • Infusoria sensu Butschli, 1887-1889
  • Ciliophyceae Rothmaler, 1951

Les Cilies ( Ciliophora , Ciliata ou Euciliata , autrefois nommes aussi ≪  Infusoires  ≫) sont un embranchement d' eucaryotes unicellulaires du regne des Chromista (historiquement des Protozoaires ). Ils sont caracterises par la presence de cils cellulaires a leur surface a au moins un instant de leur cycle.

Description [ modifier | modifier le code ]

Schema representant une paramecie . Legende : 1 - vacuole contractile, 2 - canaux radiaux, 3 -vacuole alimentaire, 4 - macronoyau , 5 - micronoyau , 6 - cils vibratils, 7 - peristome , 8 - cytopharynx , 9 - cytostome , 10 - cytoprocte .

Les Cilies sont parmi les unicellulaires les plus complexes. La cellule est polarisee, et les organites forment des zones specialisees dans la nutrition , la motricite ou l' excretion .

Ils sont d'une grande taille parmi les unicellulaires (entre 30 et 300  μm ). Leurs cils sont generalement disposes en rangees longitudinales ou obliques nommees cineties, leur extremite est encastree dans un systeme tangentiel de micro fibrilles . La repartition des cils est variable, elle peut donner des appareils locomoteurs particuliers et des structures de capture de proies. Chaque cil possede une mitochondrie qui permet son activation et des microtubules qui lui donnent rigidite et flexibilite.

Ils ont la particularite de posseder deux noyaux  : un micronoyau reproducteur qui sert pendant la mitose a la transmission du patrimoine genetique et un macronoyau vegetatif qui permet de synthetiser les proteines . La reproduction s'effectue en une division longitudinale qui permet d'obtenir deux cilies identiques.

Leur nutrition se fait par la capture de proies au niveau du peristome  : des groupements de cils appeles cirres vibrent et creent des mouvements d'eau qui aspirent les proies jusqu'a la membrane. Les proies sont ingerees par endocytose , puis digerees par les lysosomes . De nombreuses especes possedent un cytostome .

Ecologie [ modifier | modifier le code ]

Les Cilies sont presents dans les eaux douces , saumatres et marines ou ils existent sous diverses formes : formes libres nageuses , formes fixes pedonculees , formes coloniales, formes parasitaires non pathogenes ou formes symbiotiques .

Heterotrophes , ils se nourrissent de particules organiques , de bacteries , d'autres cilies, de flagelles voire d' animaux microscopiques. Leurs structures orales se specialisant selon leur regime alimentaire.

Parmi les cas particuliers bien documentes, on peut citer celui de la symbiose digestive chez la vache : les cilies presents en abondance dans la panse ( rumen ) appartiennent a un groupe tres specialise (Entodiniomorphes), dont tous les representants vivent en anaerobiose dans le tube digestif de mammiferes herbivores. Ces cilies sont egalement capables de digerer la cellulose et participent directement a la degradation de l'herbe ingeree. Mais comme ils consomment principalement les bacteries, cela maintient les populations bacteriennes en croissance exponentielle controlee, la ou elles ont un metabolisme tres rapide.

Formes fossiles [ modifier | modifier le code ]

Les plus vieux fossiles connus de Cilies sont ceux de l'ordre des Tintinnides  : ces cilies secretent des loges proteiques qui peuvent se fossiliser. Jusqu'en 2007, les plus vieux fossiles connus dataient de l' Ordovicien (- 450 Ma ). Des fossiles plus anciens ont ete trouves datant de 580 millions d'annees (periode Ediacarien ) dans la Formation de Doushantuo , a Guizhou , dans le sud de la Chine [ 1 ] .

Parmi les fossiles plus courants, les calpionelles (groupe proche des actuels Tintinnides) furent extremement abondantes pendant le Cretace , et constituent un repere utile en biostratigraphie .

Historique [ modifier | modifier le code ]

Le nom valide complet (avec auteur ) de ce taxon est Ciliophora Doflein, 1901 [ 2 ] , dont la publication originale est :

  • (de) Doflein, F., Die Protozoen als Parasiten und Krankheitserreger nach biologischen Gesichtspunkten dargestellt , Jena, Gustav Fischer, , 296  p. ( lire en ligne Accès libre) , p.  227 .

Dans les annees 1670 Antoni van Leeuwenhoek fut le precurseur de la microbiologie . Mais ce n’est que beaucoup plus tard que les cilies furent etudies de facon systematique.

En 2013 Zephyrin Fokam propose un resume de l’histoire de ces etudes, qu'il decline en plusieurs grandes periodes marquant les progres successifs [ 3 ]  :

1. Periode des decouvertes (1880-1930) : les cilies sont etudies par microscopie photonique et classes sur la base des infraciliatures buccale et somatique. Cette periode fut marquee par les travaux d’ Otto Butschli sur les protozoaires des 1876.

2. L’age d’exploitation (1924-1950) : les techniques de coloration argentique ont permis de grandes avancees, avec les travaux de Klein (1926) [ 4 ] , Chatton et Lwoff [ 5 ] , Jozsef von Gelei   (d) et Horvath [ 6 ] . C’est durant cette periode qu’ Alfred Kahl , de 1930 a 1935, a effectue la description de plus de 3000 especes.

3. L’age de l’≪ infraciliature ≫ (1933-1960) : les classifications se basent alors sur la description fine de l’infraciliature ? l’assemblage total des cinetosomes tant oraux que somatiques et leurs structures fibrillaires associees. Durant cette periode, le nombre des especes decrites double. Les grand auteurs furent Chatton et Lwoff deja cites, Faure-Fremiet [ 7 ] et Corliss .

4. L’age de l’ultrastructure (1963-1985) : voit l’analyse precise de l’ultrastructure des protozoaires. Les travaux de D. R. Pitelka [ 8 ] mettent en avant les etudes par microscopie electronique. C’est l’age de l’etude precise des arrangements de cils, appeles cineties, qui debouche sur la classification de Corliss [ 9 ] .

5. La periode actuelle, qualifie d’≪ age de raffinement ≫ (a partir de 1985) : cette periode beneficie des techniques informatiques et genetiques permettant une etude comparee a la fois de la morphologie, et des sequences des acides nucleiques des differentes lignees progressivement etablies durant les periodes precedentes ; de tester ainsi leur validite ; de tenter d'y rattacher les lignees aberrantes. Des taxonomistes comme Wilhelm Foissner   (de) et Jacques Berger marquent cette periode.

Deux classifications concurrentes des Ciliophora resultent de ces etudes : celle de Puytorac (1994), principalement base sur les caracteristiques morphologiques, et celle de Lynn (2008) qui s’appuie a la fois sur des analyses cladistiques et phenetiques .

Phylogenie [ modifier | modifier le code ]

Article detaille : Ciliata (classification phylogenetique) .

Liste des classes [ modifier | modifier le code ]

Selon le World Register of Marine Species (27 septembre 2023) [ 10 ] , d'apres la World Ciliophora Database (K. Xu, S. Agatha & J. Dolan, 2023) :

Selon le Catalogue of Life (27 septembre 2023) [ 11 ] et GBIF (27 septembre 2023) [ 12 ] , d'apres The World Ciliate Catalog (E. Aescht, 2012) :

Selon l' IRMNG (27 septembre 2023) [ 13 ]  :

Quelques especes [ modifier | modifier le code ]

Article detaille : Categorie:Espece de cilies (nom scientifique) .

On denombre environ 10 000 especes de Cilies [ 12 ] dont voici quelques exemples :

Ciliatologistes notables [ modifier | modifier le code ]

Parmi tous les chercheurs qui ont participe a la connaissance des protozoaires et, en particulier des Ciliophora, en voici un certain nombre, cites par ordre d'annee de naissance [ 14 ]  :

Notes et references [ modifier | modifier le code ]

  1. ↑ (en) C.-.W Li , J.-Y. Chen , J. H. Lipps , F. Gao , H.-M. Chi et H.-.J Wu , ≪ Ciliated protozoans from the Precambrian Doushantuo Formation, Wengan, South China ≫ , dans P. Vickers-Rich et P. Komarower, The rise and fall of the Ediacaran biota , vol.  286, London, Geological Society, coll.  ≪ Geological Society special publication ≫, ( ISBN   9781862392335 , DOI   10.1144/SP286.11 , lire en ligne ) , p.  151-156 .
  2. ↑ Guiry, M.D. & Guiry, G.M. AlgaeBase . World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. https://www.algaebase.org, consulte le 27 aout 2022
  3. ↑ Zephyrin Fokam. Etude morphologique et phylogenie des Cilies Astomes endocommensaux d’Oligochetes terricoles de la region de Yaounde et ses environs . These Universite de Yaounde : lire en ligne
  4. ↑ Klein, B. M. (1926). Ergebnisse mit einer Silbermethode bel Ciliaten. Archiv fur Protistenkunde, 56, 243?279
  5. ↑ Chatton, E., & Lwoff, A. (1930). Impregnation, par diffusion argentique, de l?infraciliature des cilies marins et d?eau douce, apres fixation cytologique et sans dessiccation. Comptes Rendus des Seances de la Societe de Biologie et de ses Filiales, 104, 834?836.
  6. ↑ Gelei, J. von, & Horvath, P. (1931). Eine nasse Silber?bzw. Goldmethode fur die Herstellung der reizleitenden Elemente bei den Cillaten. Zeitschrift fur Wissenschaftliche Mikroskopie und fur MikroskopischeTecknik , 48 , 9?29.
  7. ↑ Faure-Fremiet, E. (1950). Morphologie comparee et systematique des cilies. Bulletin societe de Zoologique de France, 75, 109?122.
  8. ↑ Dorothy Riggs Pitelka,Electron-microscopic structure of protozoa. Oxford, Pergamon Press. Macmillan, New York], 1963 : lire en ligne
  9. ↑ Corliss, J. O. (1979). The ciliated protozoa: Characterization, classification, and guide to the literature (2nd ed., 455 pp.). London/New York: Pergamon Press
  10. ↑ World Register of Marine Species , consulte le 27 septembre 2023
  11. ↑ Catalogue of Life Checklist , consulte le 27 septembre 2023
  12. ↑ a et b GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulte le 27 septembre 2023
  13. ↑ Rees, T. (compiler). The Interim Register of Marine and Nonmarine Genera . Available from https://www.irmng.org at VLIZ, consulte le 27 septembre 2023
  14. ↑ (en) John O. Corliss. A Salute to Fifty-Four Great Microscopists of the Past: A Pictorial Footnote to the History of Protozoology. Part II. Transactions of the American Microscopical Society, Vol. 98, No. 1 (Jan., 1979), pp. 26-58 : lire en ligne
  15. ↑ (en) [PDF] FOKIN Sergei Ivanovich. Biography : lire en ligne

Voir aussi [ modifier | modifier le code ]

Bibliographie [ modifier | modifier le code ]

  • Jean Theodorides , ≪  Etat des connaissances sur la structure des Protozoaires avant la formulation de la Theorie cellulaire.  ≫, Revue d'histoire des sciences , vol.  25, n o  1,‎ , p.  27?44 ( DOI   10.3406/rhs.1972.3263 , lire en ligne , consulte le )
  • Puytorac, P. de, A. Batisse, J. Bohatier, J.O. Corliss, G. Deroux, P. Didier, J. Dragesco, G. Fryd-Versavel, J. Grain, C.-A. Groliere, R. Hovasse, F. Iftode, M. Laval, M. Rogue, A. Savoie et M. Tuffrau, ≪  Proposition d'une classification du phylum Ciliophora Doflein, 1901  ≫, Comptes Rendus de l'Academie de Sciences , Paris, vol.  278,‎ , p.  2799-2802
  • (en) Eugene B. Small et Denis H. Lynn , ≪  A new macrosystem for the phylum Ciliophora doflein, 1901  ≫, Biosystems , vol.  14, n os  3-4,‎ , p.  387?401 ( DOI   10.1016/0303-2647(81)90045-9 , lire en ligne , consulte le )
  • Guillaume Lecointre , Herve Le Guyader et Dominique Visset , Classification phylogenetique du vivant , Belin, ( ISBN   978-2-7011-4273-9 )
  • (en) Erna Aescht , Catalogue of the Generic Names of Ciliates (Protozoa, Ciliophora) : Denisia 1 , Biologiezentrum Linz/Austria, ( ISSN   1608-8700 , lire en ligne Accès libre [PDF] )
  • (en) Alan Warren et al. , ≪  Beyond the “Code”?: A Guide to the Description and Documentation of Biodiversity in Ciliated Protists (Alveolata, Ciliophora)  ≫, Journal of Eukaryotic Microbiology , vol.  64, n o  4,‎ , p.  539?554 ( DOI   https://doi.org/10.1111/jeu.12391 , lire en ligne Accès libre)

Articles connexes [ modifier | modifier le code ]

Liens externes [ modifier | modifier le code ]

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