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Mindanao es el segunda isla mas grande del Filipinas y un de entre el maga tres grupos de islas del pais, con Luzon y Visayas . Tiene un historica fortaleza, de un poblacion de musulmanes . En 2006, abarca varios grupos etnicos tales como los maga Maranaos y el maga Tausug . Contrariamente a la creencia comun, Mindanao ay no nunca conquistada completamente por los maga musulmanes. De hecho, la mayoria de la poblacion nortena de Mindanao, especialmente la gente de Butuan , ay animista antes de que ellos convirti ya al cristianismo .

Varias facciones musulmanas hace una amarga lucha de independencia contra cinco siglos de ocupaciones sucesivas. Las maga fuerzas espanolas , estadounidenses , japonesas y filipinas no puede ya resoler el deseo de separacion del resto de la nacion, que en gran parte es cristiana.

El area sufrido un aumento de organizaciones terroristas islamicas relacionadas con el conflicto del Oriente Medio. Mindanao ay un base para los maga estos grupos terroristas, tales como Abu Sayyaf y Jemaah Islamiyah que minan las maga aspiraciones nacionalistas mas moderadas de los movimientos de independencia, como el frente islamico de iberacion (MILF).

Como consecuencia de decadas de emigracion hacia la region, el mayoria de la poblacion de Mindanao es ahora cristiana, lo que a muchos musulmanes desplazados y pobres les molesta mucho. Los musulmanes sigue luchando y surge movientos separatistas.