Бактериородопсин

Материал из Википедии ? свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Бактериородопсин
Тример бактериородопсина
Тример бактериородопсина
Идентификаторы
Символ Bac_rhodopsin
Pfam PF01036
InterPro IPR001425
PROSITE PDOC00291
SCOP 2brd
SUPERFAMILY 2brd
TCDB 3.E.1
OPM superfamily 6
OPM protein 1vgo
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum 3D-модель
Логотип Викисклада  Медиафайлы на Викискладе

Бактериородопси?ны  ? семейство мембранных светочувствительных белков археот (например, галобактерий ). Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану , по строению сходны с родопсинами млекопитающих .

Этот белок выполняет ту же функцию, что и хлорофилл в других организмах - обеспечивает преобразование энергии солнечного света в энергию химических связей. Он действует как зависимая от света протонная помпа . Поглощение кванта света приводит к быстрым структурным изменениям в молекуле, благодаря которым происходит перенос катиона водорода с цитоплазмы на внешнюю сторону клеточной мембраны.

Состав белка

[ править | править код ]

Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных -спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая -шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны [1] . Сидящие на -спиралях гидрофобные группы обращены ≪наружу≫ к липидам (тоже гидрофобным ) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.

Процесс переноса протона через мембрану

[ править | править код ]

Протонная проводимость осуществляется при содействии прикреплённой внутри пучка спиралей молекулы кофактора ? ретиналя . Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон , ретиналь переходит из полностью-транс- в 13-цис-форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.

Alt text

Применение бактериородопсина в нано-биотехнологиях

[ править | править код ]

В 1971 году Остерхельт (ФРГ) и Стохениус (США) сумели выделить бактериородопсин из клеточной мембраны галобактерии Halobacterium halobium [2] [3] . Природные фотопреобразующие наноматериалы используются в фармакологии, биомедицине, био- и нанотехнологиях. В 1994-м группа российских ученых впервые в мире получила пластинки с бактериородопсином. Пластинки с бактериородопсином можно применять в биомолекулярной электронике. Главный результат достижения ? ориентирование пурпурных мембран, которые содержат бактериородопсин в гидрофобных и гидрофильных средах [4] . В пластинках на желатиновой основе содержится около 50 % бактериородопсина. На основе бактериородопсина создается фоторецептор с микроэлектродом из SnO 2 и на светоизлучающие диоды подается сигнал. [5] Главное применение этого нанотехнологического материала ? в искусственных энерго- и фотопреобразующих мембранах и нанопленках.

Конформационный переход.
Мономер бактериородопсина [6] [7] [8] .
Тример бактериородопсина (вид сверху).

Примечания

[ править | править код ]
  1. А. В. Финкельштейн, О. Б. Птицын, ≪Физика белка≫, 2002
  2. Oesterhelt D., Stoeckenius W. (1971) Rhodopsin ? Like Protein from the Purple Membrane of Halobacterium Halobium, Nature, V. 233, № 89, pp. 149-60.
  3. Vought B.W., Birge R.R. (eds.) (1999) Molecular electronics and hybrid computers./in: Wiley Encyclopedia of Electrical and Electronics Engineering, Wiley-Interscience: New York,.pp. 477?490.
  4. Мосин О. В., Складнев Д. А., Егорова Т. А., Швец В. И. Получение бактериородопсина H. halobium, меченного дейтерием по остаткам ароматическим аминокислот фенилаланина, тирозина и триптофана // Биотехнология, 1996. ? № 10. ? С. 24-40.
  5. Мосин O.В., Складнев Д. А., Швец В. И. Включение дейтерированных ароматических аминокислот в молекулу бактериородопсина Halobacterium halobium // Прикладная биохимия и микробиология, 1999. ? Т. 35. ? № 1. ? с. 34-42.
  6. Nishikawa, T.; Murakami, M. Crystal structure of the 13-cis isomer of bacteriorhodopsin. RCSB Protein Data Bank (PDB) (28 марта 2005). doi : 10.2210/pdb1x0s/pdb . Дата обращения: 7 октября 2012. Архивировано 15 октября 2013 года.
  7. Nishikawa, T.; Murakami, M. Crystal structure of the 13-cis isomer of bacteriorhodopsin in the dark-adapted state.   (англ.)  // J.Mol.Biol. : journal. ? Elsevier, 2005. ? Vol. 352 . ? P. 319?328 . ? doi : 10.1016/j.jmb.2005.07.021 . ? PMID 16084526 .
  8. Image created with RasTop Архивная копия от 17 апреля 2015 на Wayback Machine (Molecular Visualization Software)