Eine
Bindungsstelle
bezeichnet in der
Biochemie
und
Pharmakologie
die Kontaktflache bei der Bindung eines
Biopolymers
an ein anderes
Molekul
.
Das Biopolymer kann eine
Nukleinsaure
, ein
Protein
oder ein
Kohlenhydrat
sein, das zweite Molekul kann dagegen auch eine
niedermolekulare Verbindung
sein. Bei
Enzymen
liegt die Bindungsstelle fur ein
Substrat
(Substratbindungsstelle) im oder in der Nahe des
aktiven Zentrums
. Die Bindungsstelle an einem
Rezeptor
oder anderen Ligaten
[1]
ist seine Kontaktflache zu
Liganden
(Ligandenbindungsstelle) oder
Inhibitoren
(
kompetitive
,
nichtkompetitive
,
unkompetitive
oder
allosterische
Bindungsstelle).
[2]
Epitope
und
Paratope
sind die Bindungsstellen zwischen
Antigenen
und
Antikorpern
.
Verschiedene Methoden wurden zur Bestimmung von
Protein-Protein-Interaktionen
,
Protein-DNA-Interaktionen
,
Protein-Lipid-Interaktionen
und
Protein-Kohlenhydrat-Interaktionen
entwickelt.
[3]
Teilweise kann die Bindungsstelle durch
molekulare Modellierung
vorhergesagt werden.
[4]
[5]
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